华东地区环境监测揭示新型肠道病毒A76/A89/A90/C113的遗传多样性及流行特征

来自中国东部的研究团队通过环境监测结合高通量测序(NGS)技术，系统解析了新型肠道病毒的流行特征。研究对2019-2021年间66份污水样本进行100倍浓缩后，通过细胞培养获得388株14种血清型病毒株，并利用VP1半巢式RT-PCR和NGS鉴定出33种血清型，其中A76/A89/A90/C113等新型毒株呈现独特进化分支。该研究为低流行潜力肠道病毒的监测提供了高效技术路径。

　　

一项历时三年的环境监测研究揭开了中国东部地区肠道病毒组的"神秘面纱"。科研人员采用带负电荷膜浓缩法，将66份污水样本浓缩100倍后展开双线作战：一方面通过细胞培养捕获388株病毒"活体"，包括22株I型脊髓灰质炎减毒株(Sabin-like PV1)和57株III型；另一方面对样本进行RNA提取，通过VP1半巢式RT-PCR扩增获得56个产物，借助下一代测序(NGS)技术绘制出更完整的病毒图谱。

数据令人惊艳——NGS检测到33种血清型，其中埃可病毒11型(Echovirus 11)以29.11%的reads占比独占鳌头，柯萨奇病毒A10型(Coxsackievirus A10)、埃可病毒18型、柯萨奇病毒B4/B5型紧随其后。更引人注目的是四种新型病毒：A76、A89、A90和C113分别在1.52%、25.76%、7.58%和9.09%的样本中被"揪出"。系统发育分析显示，这些病毒在VP1编码区形成了独特的进化分支，宛如病毒界的"新贵家族"。

该研究不仅证实污水是监测肠道病毒多样性的"宝库"，更凸显NGS技术相较传统细胞培养的碾压性优势——就像用高清卫星地图替代手绘草图，为追踪新型肠道病毒提供了"火眼金睛"。