乳腺癌骨转移脂代谢相关预后生物标志物(RGS9BP与SOCS3)的发现及机制研究

来自UCSC Xena数据库的研究团队通过整合乳腺癌(BRCA)样本测序数据，首次揭示脂代谢与骨转移预后的关联。研究通过差异基因分析(DEGs1/DEGs2)与脂代谢评分基因(LMSRGs)交叉筛选DE-LMSRGs，结合机器学习(SVM-RFE)鉴定出RGS9BP和SOCS3两个关键生物标志物。研究发现9种免疫细胞亚群差异，构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络(如HLX-AS1-hsa-mir-541-SOCS3)，并通过分子对接证实SOCS3与叶酸/雌二醇的稳定结合。该成果为BRCA骨转移预后评估提供新靶点。

　　

这项突破性研究揭示了脂质代谢在乳腺癌(BRCA)骨转移进程中的关键作用。科研团队从UCSC Xena数据库获取BRCA样本测序数据，通过三重筛选策略——比较BRCA组与对照组的差异基因(DEGs₁)、骨转移与非骨转移组的差异基因(DEGs₂)以及脂代谢评分相关基因(LMSRGs)，最终锁定脂代谢相关差异表达基因(DE-LMSRGs)。

研究采用支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)等算法，鉴定出G蛋白信号调节因子结合蛋白(RGS9BP)和细胞因子信号抑制因子3(SOCS3)两个核心生物标志物。免疫浸润分析显示，活化树突状细胞、中性粒细胞等9类免疫细胞在骨转移组呈现显著差异。更引人注目的是，团队构建了包含HLX-AS1-hsa-mir-541-SOCS3等调控对的lncRNA-miRNA-mRNA网络。

分子对接实验证实，SOCS3与叶酸、雌二醇、S-腺苷甲硫氨酸形成的复合物具有超常稳定性，而RGS9BP与苯并芄的结合同样表现突出。血管生成评分分析进一步显示，这两个标志物与多数血管生成相关基因(ARGs)存在显著关联。这些发现为开发BRCA骨转移精准诊疗策略提供了全新视角。