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为解析中国类 NADC30 猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）的复杂重组模式及流行规律，研究人员对 254 株病毒全基因组序列进行分析，发现重组株占比超 87%，以 L1C+L8E 重组为主，划分出 12 个重组群（NADC30-R1 至 R12），揭示其传播与致病特征，为 PRRS 防控提供关键依据。
猪繁殖与呼吸综合征（Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome, PRRS）是全球养猪业的重大威胁，其病原猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）因高变异性和重组频繁性，给防控带来巨大挑战。在中国，自 2016 年以来类 NADC30 PRRSV 成为优势流行株，但其基因组特征和流行病学动态尚不明晰，尤其是复杂的重组模式与低全基因组同源性问题，迫切需要系统性研究以揭示其演化规律和传播风险。
为解决这一难题，中国农业科学院哈尔滨兽医研究所的研究人员开展了深入研究。他们通过高通量测序获得 30 株类 NADC30 PRRSV 全基因组序列，并整合 GenBank 中 224 株中国株数据，构建了包含 254 株病毒的数据集，旨在全面解析该病毒的基因组特征、重组模式及地理分布规律。研究成果发表在《Porcine Health Management》，为 PRRS 的科学防控提供了重要理论支撑。
研究采用的关键技术方法包括：① 下一代测序（Next-Generation Sequencing, NGS）获取病毒全基因组序列；② 利用 MAFFT 和 IQ-TREE 软件进行序列比对和系统发育树构建；③ 通过 RDP4 和 Simplot 软件检测重组事件及断点定位；④ 结合 Clustal W 和 MEGA12 分析 Nsp2 蛋白氨基酸序列及遗传距离；⑤ 基于 NB MAP 和 GraphPad Prism 进行地理分布和统计分析。
重组趋势与优势模式
通过分析 2012-2023 年的数据，研究发现类 NADC30 PRRSV 重组事件呈逐年上升趋势，非重组株已近乎消失。其中，以 L1C（NADC30-like）和 L8E（JXA1-like）为亲本的重组模式最为普遍，占比达 48%（107/223）。2021-2023 年数据显示，仅 2.15% 的毒株为非重组，表明重组已成为该病毒演化的核心特征。
病毒分类与遗传特征
基于系统发育和重组分析，研究将 120 株具有相似重组特征的病毒划分为 12 个重组群（NADC30-R1 至 R12）。群内遗传距离约为 5.73%（SD±1.68），而群间距离稳定超过 10%，显示分类的可靠性。所有重组群毒株均在 Nsp2 蛋白中存在特征性 131 个氨基酸的不连续缺失（322-432、483、504-522 位），这一结构与 NADC30 毒株一致，但不同群组间未发现 Nsp2 的特异性差异。
致病性与地理分布
致病性分析表明，多数类 NADC30 PRRSV 表现为中等毒力，但部分重组群（如 R1、R2、R4、R8）中存在高致病株，例如 SD17-38（R1）和 SCcd2020（R2）可导致仔猪死亡。值得注意的是，同一重组群内毒株的致病性存在差异，提示重组模式并非唯一毒力决定因素。地理分布显示，病毒覆盖中国 19 个省份，其中 NADC30-R1 和 R2 分布最广、数量最多，尤其在黑龙江、福建、广东和河南等养猪大省形成局部流行，显示其强大的传播能力和适应性。
研究结论与意义
本研究首次系统揭示了中国类 NADC30 PRRSV 的基因组演化规律，证实其以复杂重组为主要特征，且 L1C+L8E 重组模式主导流行。通过定义 12 个重组群，为病毒监测提供了精准分类框架。研究发现 Nsp2 的特征性缺失在重组中稳定保留，暗示该结构可能与病毒适应性相关，但具体机制仍需深入探究。此外，NADC30-R1 和 R2 的广泛传播提示需加强重点区域的防控，尤其是针对重组毒株的跨区域扩散风险。
该研究不仅深化了对 PRRSV 演化动力学的认识，也为疫苗研发和流行病学监测提供了关键靶点。未来需持续关注多亲本重组毒株的 emergence，以应对不断变化的疫情挑战。研究结果为建立 “基因型 - 流行特征 - 防控策略” 的联动体系奠定了基础，对保障中国养猪业健康发展具有重要意义。
