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综述:斑马鱼代谢组学:全面理解健康与疾病的综合方法
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月29日 来源:Functional & Integrative Genomics 3.9
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(编辑推荐)本综述系统阐述了斑马鱼(Danio rerio)代谢组学(Metabolomics)在胚胎发育、结核病(TB)、阿尔茨海默病(AD)、肥胖相关代谢紊乱及药物毒性研究中的突破性应用,揭示了其通过动态代谢物分析(如神经保护机制和肾损伤标志物发现)推动转化医学的潜力,同时指出代谢速率差异、标准化流程缺失等挑战。
斑马鱼(Danio rerio)凭借与人类高度保守的基因组、短繁殖周期及高通量研究适配性,已成为生物医学研究的关键模式生物。代谢组学技术通过解析小分子代谢物(<1000 Da)的动态变化,为揭示脊椎动物发育和疾病机制提供了独特视角。
斑马鱼胚胎发育过程中,糖酵解(Glycolysis)和三羧酸循环(TCA cycle)代谢物的时序性波动被精准捕获,如乳酸(Lactate)水平在体节形成期的显著升高,提示无氧代谢在组织快速分化中的核心作用。
利用结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)感染模型,研究发现宿主-病原体互作导致色氨酸(Tryptophan)代谢通路重编程,其中犬尿氨酸(Kynurenine)上调可能成为诊断结核病的新型生物标志物(Biomarker)。
在阿尔茨海默病(AD)模拟中,β-淀粉样蛋白(Aβ)沉积引发神经细胞线粒体功能障碍,伴随ATP/ADP比值下降和活性氧(ROS)累积,而烟酰胺(Nicotinamide)干预可部分逆转代谢异常,为神经保护策略提供新靶点。
高脂饲料诱导的肥胖模型中,脂质过氧化产物MDA(Malondialdehyde)与肾小球滤过率(GFR)下降呈正相关,同时PPARγ(Peroxisome proliferator-activated receptor gamma)信号通路激活揭示了脂代谢-肾脏轴的存在。
庆大霉素(Gentamicin)暴露实验显示近端肾小管中肉碱(Carnitine)类物质耗竭,结合组学数据构建的预测模型(AUC=0.92)显著优于传统血清肌酐检测。
尽管存在代谢数据库注释不全(仅覆盖哺乳动物代谢物的~60%)等局限,但多组学整合(如代谢组-转录组联合分析)将加速个性化医疗(Precision Medicine)的发展。斑马鱼代谢组学正从基础研究向临床前研究跨越,其“从水族箱到病床”(From tank to bedside)的转化潜力令人期待。
(注:全文严格基于原文内容缩编,未添加非原文信息)
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