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新加坡褐藻Sargassum ilicifolium中Sagittula sp. SSi028的基因组草图揭示其DMSP代谢与群体感应调控机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月29日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.7
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来自新加坡的研究团队针对海洋褐藻共生菌Sagittula sp. SSi028开展基因组学研究,解析了其双途径DMSP(二甲基磺基丙酸)同化、木质素降解及维生素B1-B12合成基因特征,发现luxI-luxR群体感应(QS)系统可能调控宿主互作,为藻菌共生机制及海洋碳循环研究提供新见解。
从新加坡圣约翰岛采集的褐藻Sargassum ilicifolium中分离出一株新型海洋细菌Sagittula sp. SSi028。基因组分析显示,该菌株具有双途径DMSP代谢能力——既能通过dddW基因介导的裂解途径分解DMSP,又能利用dmdB/dmdC基因完成去甲基化代谢。更引人注目的是,其基因组携带pcaB/D/F等基因簇,暗示其可能通过β-酮己二酸途径降解木质素类芳香化合物,这在海洋碳循环中扮演关键角色。
作为典型的玫瑰杆菌科(Roseobacteraceae)成员,SSi028展现出与宿主的精密互作网络:不仅能合成维生素B1、B2、B5、B6和B12满足宿主需求,还装备了完整的群体感应(QS)系统——包括1个luxI合成酶基因和3个luxR调控因子基因,配合酰基高丝氨酸内酯水解酶,形成精密的"信号发射-接收-降解"调控回路。
研究团队采用Illumina HiSeq XTM平台完成150bp双端测序,经SPAdes组装获得3.9Mb基因组草图(含80个contigs,N50达436kb)。比较基因组学显示其与近缘种Sagittula marina的ANI值仅76.95%,暗示为新物种。这些发现为理解海洋藻际微生物的生态功能提供了分子层面的新证据,尤其在有害藻华防控和生物资源回收领域具有应用潜力。
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