俄亥俄州患者血液中分离的Dolosicoccus paucivorans DSM 15742T全基因组序列解析及其临床意义

推荐 本研究针对1995年俄亥俄州一名患者血液中分离出的未鉴定革兰氏阳性球菌，通过全基因组测序揭示其分类学地位及潜在致病性。该菌株被命名为Dolosicoccus paucivorans DSM 15742T，基因组全长1.8 Mb，含1,752个编码基因及多种毒力因子，为理解其致病机制及抗生素耐药性提供了关键数据。

　　

翻译
1995年，俄亥俄州克利夫兰市一名78岁男性因肺炎症状入院，其血液样本中分离出一种此前未被鉴定的革兰氏阳性球菌，该菌株呈过氧化氢酶阴性、α溶血性特征。通过16S rRNA测序及生化测试，该菌被命名为Dolosicoccus paucivorans 2991-95（DSM 15742^T）。后续研究发现，除血液外，该菌还存在于人体宫颈及泌尿微生物群中，但其致病机制尚不明确。

本研究作为“细菌与古菌基因组百科全书”项目的一部分，对该菌株进行了全基因组测序。研究团队从DSMZ培养基（编号92）中培养该菌，并采用Masterpure Gram-positive DNA提取试剂盒提取DNA，随后通过Illumina HiSeq 2500平台完成测序。原始数据经BBDuk过滤后，利用Velvet和Allpaths-LG进行组装，最终获得1,759,599 bp的基因组序列，GC含量为37.91%，包含107个contigs及1,752个蛋白编码基因。

基因组完整性评估显示其完整度为96.89%，污染率为0.16%。功能注释揭示该菌携带多种毒力因子，包括黏附素、免疫调节蛋白及铁捕获相关基因，并检测到氨基糖苷类（aadD1）及博来霉素（bleO）耐药基因。系统发育分析表明其与Leuconostoc gelidum等物种亲缘关系较近。CRISPR位点的存在提示该菌可能具备适应性免疫能力。本研究为理解该菌的生物学特性及潜在临床影响提供了重要依据。