蝙蝠 ACE2 作为 HKU5 冠状病毒受体的机制研究及跨物种传播风险解析

【字体: 时间:2025年05月29日 来源:Nature Communications 14.7

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  为探究 merbecovirus 亚属冠状病毒的人类威胁潜力,研究人员以嵌合刺突蛋白(spike)构建假病毒,分析受体趋向性。发现 HKU5 蝙蝠冠状病毒利用日本伏翼蝠(Pipistrellus abramus)ACE2 受体,其刺突三聚体结构仅呈现 “向下” RBD 构象,为冠状病毒跨物种传播风险评估及广谱疫苗开发提供依据。

  在冠状病毒的大家族中,β 冠状病毒亚属的 merbecovirus 分支一直备受关注。中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)作为该分支的代表成员,自 2012 年被发现以来,已导致多次人类严重呼吸道感染疫情,其从单峰骆驼向人类的跨物种传播机制虽已部分阐明,但该亚属中大量蝙蝠等野生动物携带的病毒仍笼罩在未知阴影中。目前,全球已测序的冠状病毒中绝大多数未被分离或分子特征化,它们的跨物种传播潜力,尤其是向人类溢出的风险,如同悬在头顶的 “达摩克利斯之剑”,亟待深入研究。病毒进入宿主细胞是跨物种传播的关键步骤,而刺突蛋白(spike)与宿主受体的相互作用又是这一过程的核心。因此,解析 merbecovirus 亚属病毒的受体使用机制,成为评估其人类威胁潜力的关键一环。
为了系统揭开 merbecovirus 亚属病毒的受体奥秘,美国北卡罗来纳大学教堂山分校、加州理工学院等机构的研究人员开展了一系列研究。他们开发了一种名为 “MerbecoType” 的高通量分析方法,基于嵌合刺突蛋白构建假病毒(VSV pseudotype),对整个 merbecovirus 亚属的病毒进入细胞机制进行评估。研究发现,merbecovirus 可根据刺突蛋白受体结合域(RBD)的序列特征分为 4 个进化枝(clade),且受体趋向性呈现枝特异性:包含 MERS-CoV 的 clade 1 使用二肽基肽酶 4(DPP4)作为受体,而多个其他进化枝(如包含 HKU5 蝙蝠冠状病毒的 clade 2)则使用血管紧张素转换酶 2(ACE2)。相关研究成果发表在《Nature Communications》上。

研究人员主要采用了以下关键技术方法:一是假病毒构建与细胞感染实验,通过将不同病毒的 RBD 替换到 MERS-CoV 刺突蛋白骨架中,制备假病毒并感染表达不同受体的细胞系,检测病毒进入效率;二是冷冻电镜(cryo-EM)技术,用于解析 HKU5 刺突三聚体的三维结构;三是分子克隆与活病毒感染实验,构建具有复制能力的 HKU5 分子克隆,验证其在宿主细胞中的复制能力;四是酶联免疫吸附试验(ELISA),检测 RBD 与受体蛋白的直接结合能力。此外,研究还涉及受体基因克隆、细胞稳定转染、突变分析及系统发育分析等技术。

关键研究结果


功能性受体结合域的定位与受体切换验证


研究人员通过在 MERS-CoV 刺突蛋白中替换不同病毒的 RBD,发现 RBD 边界可通过保守甘氨酸残基确定。以 PDF2180 病毒的 RBD 替换为例,成功实现了 MERS-CoV 刺突蛋白从识别 DPP4 到 ACE2 的受体切换,证明了该嵌合系统的有效性。实验显示,PDF2180 的 RBD 区域(含保守甘氨酸侧翼序列)是受体结合的关键,缩短该区域会导致受体识别能力丧失。

merbecovirus RBD 进化枝分类与受体趋向性


对 GenBank 中筛选的 65 个刺突序列(代表 34 种独特 RBD)进行系统发育分析,将 merbecovirus RBD 分为 4 个进化枝(clade 1-4)。假病毒感染实验表明,clade 1(如 MERS-CoV、HKU4)特异性使用 DPP4;clade 2(HKU5)和 clade 3(如 NeoCoV、PDF2180)使用 ACE2,但 clade 2 表现出严格的宿主特异性,仅日本伏翼蝠(Pipistrellus abramus)的 ACE2 能支持其高效感染,而 clade 3 可识别更广泛物种的 ACE2;clade 4(如 ErinCoV)的受体尚未明确,其在部分人类细胞系中的低水平感染可能依赖外源胰酶。

HKU5 病毒与蝙蝠 ACE2 的特异性相互作用


通过构建 HKU5 全长刺突蛋白假病毒及分子克隆,证实其仅在表达P. abramus ACE2 的细胞中高效复制,而在其他物种 ACE2 细胞中表现微弱。ELISA 实验进一步显示,HKU5 的 RBD 与P. abramus ACE2 存在特异性结合,且突变分析表明,RBD 的 Loop 2 区域对受体结合至关重要,该区域的氨基酸缺失可能限制病毒的进化适应性。

HKU5 刺突三聚体结构特征


冷冻电镜结构显示,HKU5-20s 刺突三聚体的所有 RBD 均处于 “向下” 构象,与其他冠状病毒刺突中常见的 “向上 / 向下” 混合构象不同。这种封闭构象可能与病毒在宿主胃肠道的传播策略相关,低 pH 环境或外源蛋白酶可能触发其构象转换以结合受体。

研究结论与意义


本研究系统揭示了 merbecovirus 亚属的受体使用规律,特别是 HKU5 蝙蝠冠状病毒依赖特定蝙蝠物种 ACE2 的机制,为该类病毒的跨物种传播风险评估提供了关键依据。研究发现,尽管 HKU5 目前对人类 ACE2 的结合能力较低,但其刺突蛋白的结构可塑性(如 Loop 2 区域的突变潜力)可能赋予其适应人类受体的潜力,需警惕其潜在的进化威胁。此外,HKU5 刺突三聚体的独特构象为冠状病毒疫苗设计提供了新靶点,有助于开发针对 merbecovirus 亚属的广谱疫苗。该研究不仅深化了对冠状病毒 - 宿主相互作用的理解,也为 “同一健康”(One Health)框架下的新发传染病防控提供了重要科学支撑。

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