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产前空气污染暴露与哮喘过敏相关基因DNA甲基化的关联:ECHO队列研究揭示关键窗口期
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月29日 来源:Environmental Epigenetics 4.8
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本研究通过ECHO项目2294份儿童生物样本的DNA甲基化分析,发现产前O3、NO2和PM2.5暴露与154个免疫相关基因的甲基化改变显著相关,95%的关联具有污染物-组织-时间窗口特异性。创新性使用Asthma&Allergy甲基化芯片和分布式滞后模型,首次系统揭示不同孕期阶段空气污染对表观遗传的差异化影响,为环境暴露致儿童哮喘的机制研究提供新靶点。
空气污染已成为全球公共卫生的重大威胁,尤其对发育中的胎儿影响深远。既往研究表明,产前暴露于臭氧(O3)、二氧化氮(NO2)和细颗粒物(PM2.5)与儿童哮喘和过敏性疾病风险增加相关,但具体生物学机制尚不明确。虽然表观遗传修饰尤其是DNA甲基化被认为是潜在中介机制,但先前研究受限于样本量小、检测范围窄(仅覆盖450K/EPIC芯片的CpG位点)以及组织特异性分析不足等问题,难以系统揭示污染暴露与健康结局间的分子桥梁。
为突破这些限制,由约翰霍普金斯大学、芝加哥大学等机构组成的ECHO(Environmental Influences on Child Health Outcomes)联盟开展了一项开创性研究。团队设计了一种新型Asthma&Allergy甲基化芯片,专门富集与哮喘过敏相关的37,863个CpG位点,其中94%位于预测增强子区域,90%位于转录因子结合位点。相比传统芯片,该技术显著提高了中等甲基化水平CpG的覆盖度——这类位点正是基因调控的关键区域。研究纳入1906名儿童的五类生物样本(胎盘、脐带血、口腔拭子、鼻黏膜和灌洗液),结合高时空分辨率的污染暴露模型,首次全面解析了产前空气污染对不同发育阶段儿童表观基因组的影响。
关键技术方法包括:1)使用Asthma&Allergy芯片检测37,197个CpG位点的甲基化水平;2)基于神经网络和卫星数据的1km×1km网格化污染暴露评估;3)基因水平的"有符号"和"无符号"关联检验;4)分布式滞后模型识别关键暴露窗口;5)ECHO多中心队列的标准化数据采集(样本跨1988-2017年出生队列)。
研究结果呈现三大重要发现:
污染物特异性模式:在154个显著关联基因中,O3、NO2和PM2.5分别关联77、36和49个基因,仅8个基因与多种污染物相关。例如SERPINB6基因在胎盘和脐带血中持续响应NO2暴露,提示该丝氨酸蛋白酶抑制剂可能是跨组织的共同靶点。
时空特异性效应:95%的关联具有暴露窗口-污染物-组织三重特异性。胎盘对O3最敏感(检出32个基因),而PM2.5在鼻黏膜中关联最多(13个基因)。关键窗口分析显示,第一和第三 trimester(妊娠期)是甲基化改变最显著的阶段,如组蛋白基因HIST1H3PS1在孕早期暴露后出现跨组织(口腔与脐带血)甲基化改变。
动态暴露响应:分布式滞后模型揭示21个基因呈现六类时间响应模式。典型如AL662890.3基因呈"负向蛇形"趋势(A型),孕早期和晚期暴露影响显著;而SERPINB6则呈现"U型"响应(C型),孕中期暴露最为关键。这些模式为理解发育敏感期提供了精细时间坐标。
讨论部分强调,该研究通过技术创新和规模优势取得重要突破:首先,Asthma&Allergy芯片的设计使检测效力比传统方法提高近10倍;其次,多组织比较揭示胎盘和脐带血可能作为污染暴露的敏感生物标志物;最后,关键窗口的识别为精准干预提供时机指引。特别值得注意的是,发现的甲基化改变幅度显著(部分基因达9.98%/单位暴露量),且靶基因多参与免疫调节(如AHRR、GLRX等),为环境暴露致哮喘的"发育起源假说"提供了分子证据。
这项发表在《Environmental Epigenetics》的研究,不仅建立了空气污染与儿童健康间的表观遗传桥梁,其创新的研究方法也为其他环境健康研究树立了新范式。未来研究可进一步探索这些甲基化标志物能否预测临床结局,以及是否可作为干预靶点逆转污染的健康危害。
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