
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
基于密度泛函理论对T3P介导的环化反应比较研究:Robinson–Gabriel合成与Bischler–Napieralski反应机制解析
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月29日 来源:European Journal of Organic Chemistry
编辑推荐:
推荐 为解决β-咔啉类生物碱高效合成中反应选择性不足的问题,研究人员通过密度泛函理论(DFT)比较了T3P介导的Robinson–Gabriel合成与Bischler–Napieralski反应机制。研究表明,底物结构显著影响反应路径,oxoalkyl tryptamide优先发生Robinson–Gabriel环化,而Bischler–Napieralski反应需更高活化能。该发现为优化反应条件提供了理论依据,对药物化学研究具有重要意义。
论文解读
β-咔啉类化合物作为生物碱的重要结构单元,广泛存在于自然界并展现出多样的生物活性,如抗菌[1]、抗疟疾[2]和抗癌[3]等作用。然而,其合成方法的选择性和效率长期存在挑战。为此,来自欧洲的研究团队通过密度泛函理论(DFT)计算,系统比较了T3P介导的Robinson–Gabriel合成与Bischler–Napieralski反应机制,揭示了底物结构对反应路径的关键影响。
研究人员采用M062X/6–31?+?G(d,p)级别的DFT计算,并结合SMD溶剂模型模拟N,N-二甲基甲酰胺(DMF)环境,分析了两种模型底物——N-乙酰基-β-氧代色胺(A1)和N-乙酰色胺(C1)的反应路径。结果显示,A1在T3P作用下优先通过氧原子亲核进攻形成中间体INT1b,随后经历nitrilium离子中间体INT2b的消除步骤,最终以194.9?kJ?mol-1的活化能完成Robinson–Gabriel环化生成pimprinine(3)。而C1则因缺乏oxo基团的电子效应,其nitrilium离子中间体INT2c的活化能高达269.4?kJ?mol-1,导致Bischler–Napieralski反应难以进行。
研究进一步指出,T3P的磷酰基通过促进离去基团(T3P-OH)的脱离,显著降低了Robinson–Gabriel反应的能垒。相比之下,Bischler–Napieralski反应需克服更高的过渡态能量(TS3b),且生成的β-咔啉环中间体INT3b稳定性较差(ΔG=229.3?kJ?mol-1)。实验验证表明,在相同条件下,A1的转化率达50%仅需20分钟,而C1的反应半衰期(t1/2)为16分钟,最终转化率显著低于前者。
该研究不仅阐明了T3P介导环化反应的选择性机制,还为设计高效合成路径提供了理论指导。其成果发表于《European Journal of Organic Chemistry》,对药物化学领域优化生物碱合成策略具有深远影响。
主要技术方法
本研究采用密度泛函理论(DFT)计算,结合SMD溶剂模型模拟DMF环境,分析了底物结构对反应路径的影响。通过比较过渡态能量和中间体稳定性,揭示了反应选择性的分子机制。
研究结果
Robinson–Gabriel合成机制:A1通过氧原子亲核进攻形成INT1b,经nitrilium离子中间体INT2b消除T3P-OH,最终以194.9?kJ?mol-1活化能完成环化。
Bischler–Napieralski反应障碍:C1因缺乏oxo基团导致INT2c活化能高达269.4?kJ?mol-1,且INT3b稳定性差,反应难以进行。
实验验证:A1在20分钟内转化率达50%,而C1的t1/2为16分钟,最终转化率显著低于A1。
研究结论
底物结构显著影响T3P介导环化反应的选择性。oxo基团的电子效应提升了Robinson–Gabriel反应的效率,而Bischler–Napieralski反应因高能垒和中间体不稳定性难以发生。该研究为优化生物碱合成策略提供了理论依据,对药物化学领域具有重要指导意义。
生物通微信公众号
知名企业招聘