中国喀斯特洞穴新型嗜麦芽窄食单胞菌噬菌体vB_Srh_LBjhp91a的基因组特征与分类学地位

【字体: 时间:2025年05月30日 来源:Archives of Virology 2.5

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  来自中国的研究人员从喀斯特洞穴中分离出一株新型嗜麦芽窄食单胞菌噬菌体vB_Srh_LBjhp91a,通过全基因组测序揭示其63,966 bp环状dsDNA基因组特征(60.7% G+C含量含83个ORFs和2个tRNAs)。BLASTn显示与Xooduovirus属噬菌体vB_Sm_QDWS359具有80.95%序列相似性,系统发育分析基于DNA聚合酶和末端酶大亚基基因将其归类为Xooduovirus属新种,为噬菌体资源挖掘和分类学研究提供重要参考。

  

在中国喀斯特洞穴中发现的新型嗜麦芽窄食单胞菌噬菌体(Stenotrophomonas phage) vB_Srh_LBjhp91a展现出独特的基因组特征。其63,966碱基对的环状双链DNA(dsDNA)基因组拥有60.7%的鸟嘌呤+胞嘧啶(G+C)含量,编码83个预测开放阅读框(ORFs)和2个转运RNA(tRNAs)。通过核酸序列比对(BLASTn),该噬菌体与Xooduovirus属成员vB_Sm_QDWS359显示出80.95%的相似性,但平均核苷酸一致性(ANI)仅为71.7%。

有趣的是,基于DNA聚合酶(DNA polymerase)和末端酶大亚基(terminase large subunit)构建的系统发育树将其与Bosavirus、Elanorvirus和Xooduovirus属成员聚为一支。蛋白质组学分析进一步证实其与vB_Sm_QDWS359的亲缘关系。这些发现不仅拓展了我们对极端环境噬菌体多样性的认知,更提示vB_Srh_LBjhp91a应被归类为Xooduovirus属的新物种,为噬菌体分类学提供了重要案例。

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