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为探究 HIV-1 CRF55_01B 在河南 PLWHA 中的耐药及传播情况，研究人员对 245 例感染者开展基因分型与分子网络分析。发现初治者 PDR 为 19.86%，经治者 ADR 达 89.42%，且存在传播集群，为防控提供重要依据。
在艾滋病防控的复杂版图中，人类免疫缺陷病毒 1 型（HIV-1）的快速变异与传播始终是横亘在科研人员与临床医生面前的难题。作为一种正链 RNA 病毒，HIV-1 凭借其逆转录酶的高复制能力与低保真度特性，不断演化出多样的亚型和重组形式（CRFs）。在中国，以 CRF01_AE 和 CRF07_BC 为主的重组毒株已成为新发感染的主流，而 CRF55_01B 作为 CRF01_AE 与亚型 B 的重组株，自 2013 年在深圳男男性行为人群（MSM）中被首次发现后，便以惊人的速度向全国扩散，甚至从 MSM 人群外溢至异性恋人群。河南作为中国 HIV 高流行省份之一，2022 年报告现存感染者超 7.1 万例，新发感染 3596 例，CRF55_01B 在此省的流行态势已升至初治感染者中第四位，且其感染者在启动抗逆转录病毒治疗（ART）时血浆病毒载量（VL）更高，这一系列现象迫切需要深入探究其耐药特征与传播规律，以遏制耐药毒株的扩散并优化治疗策略。
为破解 CRF55_01B 在河南的传播与耐药谜团，郑州大学附属传染病医院（河南省传染病医院、郑州市第六人民医院）的研究团队开展了一项针对该毒株的全面研究。研究成果发表在《Retrovirology》，通过对 2018 年 1 月至 2023 年 12 月期间就诊于该院的 HIV 感染者进行筛查，最终纳入 245 例 CRF55_01B 感染者（141 例初治未治疗者、104 例经治患者），系统分析其耐药突变（DRMs）分布、耐药类型（ pretreatment drug resistance, PDR；acquired drug resistance, ADR）及分子传播网络，旨在为河南乃至全国的 HIV-1 防控提供关键科学依据。
研究人员采用的关键技术方法包括：①样本采集与基因扩增：提取感染者 HIV-1 部分 pol 基因（HXB2 2253-3353）及全长整合酶（INT）基因（HXB2 4230-5093），通过逆转录和 PCR 扩增获得目的片段；②亚型鉴定与系统发育分析：利用 REGA HIV-1 分型工具及 MEGA 软件构建系统发育树，基于通用时间可逆加伽马模型（GTR+Γ）确认毒株亚型；③耐药突变分析：依托斯坦福 HIV 耐药数据库（Stanford HIVdb），参照世界卫生组织（WHO）监测列表，对核苷类逆转录酶抑制剂（NRTIs）、非核苷类逆转录酶抑制剂（NNRTIs）、蛋白酶抑制剂（PIs）及整合酶链转移抑制剂（INSTIs）相关突变进行判读，通过 penalty score 算法评估耐药水平；④分子传播网络构建：运用 MEGA 和 HyPhy 软件对 pol 基因序列进行比对与遗传距离计算，以≤1.5% 遗传距离界定传播关联，借助 Cytoscape 软件可视化传播集群（TCs）。
一、研究对象基本特征
245 例感染者中，男性占比 94.29%，中位年龄 36 岁，46.53% 经 MSM 途径感染，31.84% 为异性传播。初治组 CD4+ T 细胞计数中位值为 106 cells/μl，经治组主要接受以 TDF+3TC+EFV 为主的一线方案（69.23%）。值得注意的是，经治患者中 89.42% 存在至少一种耐药突变，凸显长期治疗带来的耐药压力。
二、耐药突变分布与耐药类型
初治人群中，19.15% 携带 NNRTIs 耐药突变（除 V179E/D），6.38% 存在 NRTIs 突变，以 M184V/I（3.55%）和 S68G（2.13%）为主，未检测到 PI 和 INSTI 突变，PDR 率为 19.86%，显著高于国内其他地区及 CRF07_BC、CRF01_AE 毒株。经治人群中，耐药形势更为严峻：88.46% 携带 NNRTIs 突变（K103N 占 60.58%），82.69% 存在 NRTIs 突变（M184V/I 达 76.92%），2% 检出 INSTI 突变（N155H 等），ADR 率高达 89.42%。值得关注的是，82.69% 的经治者存在 NRTIs+NNRTIs 双类突变，M184V/I+K103N 组合最为常见（52.88%），提示传统一线方案在该人群中面临较高失败风险。
三、临床常用药物耐药水平
对核苷类药物，经治者中拉米夫定（3TC）和恩曲他滨（FTC）的中高水平耐药率最高（均超 70%），初治者亦存在低水平耐药趋势；非核苷类药物中，奈韦拉平（NVP）和依非韦伦（EFV）的中高水平耐药在两类人群中均显著，与临床广泛使用该类药物密切相关；整合酶抑制剂仅在 2 例经治者中检出耐药，显示其作为二线方案的潜力。
四、传播特征与分子网络
研究共识别出 23 个传播集群，涵盖 37.55% 的序列，其中 65.22% 的集群包含≥3 例感染者，最大集群达 19 例。值得警惕的是，13 个集群存在耐药毒株，7 个集群同时包含初治与经治感染者，提示耐药突变可能通过传播链在人群中扩散，尤其是经治者的耐药毒株向初治人群传播的潜在风险。
研究结论表明，CRF55_01B 在河南 HIV 感染者中呈现高耐药负荷特征，初治人群的 PDR 率已超 WHO 建议的 10% 阈值，提示需紧急考虑以整合酶抑制剂为基础的非 NNRTIs 一线方案；经治人群的高 ADR 率则警示传统方案的有效性面临严峻挑战，需加强治疗监测与个体化方案调整。分子传播网络显示近四成感染者存在密切遗传关联，且耐药毒株在集群中扩散，凸显切断传播链与控制耐药传播的双重紧迫性。
讨论部分指出，CRF55_01B 的快速扩散与其在 MSM 人群中的高效传播及交通网络发展相关，而 V179E 等天然突变与其他耐药突变的协同作用，可能加剧 NNRTIs 类药物失效。研究首次系统揭示该毒株在中原地区的耐药谱与传播模式，为中国 HIV-1 耐药防控策略提供了区域性数据支撑，尤其是对高流行省份的毒株监测、治疗方案优化及精准干预具有重要指导意义。尽管研究受样本量限制，但其发现已为后续大规模队列研究及耐药预警体系构建奠定了基础。
