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尼日利亚恩古和纳萨拉瓦州乙肝病毒分子流行病学研究:基因型分布与耐药突变分析
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月30日 来源:BMC Infectious Diseases 3.4
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为解决乙肝病毒(HBV)基因型分布及耐药突变监测问题,研究人员对尼日利亚恩古和纳萨拉瓦州储存样本进行分子流行病学分析。通过Qubit 4荧光仪和Nanodrop One分光光度计筛选高质量样本,结合巢式PCR和Sanger测序技术,发现基因型E占主导(85.7%),未检出耐药突变。该研究为西非HBV防控提供了关键分子数据。
乙肝病毒(HBV)感染仍是全球公共卫生重大挑战,尤其在尼日利亚等资源有限地区。尽管疫苗可预防,但HBV基因型的地理分布差异、耐药突变风险及与疾病进展的关系尚未完全阐明。西非地区流行的基因型E具有高慢性化率和致癌潜力,但相关分子特征研究匮乏。此外,长期储存样本的稳定性问题也制约着回顾性研究的可靠性。
为填补这些空白,来自尼日利亚疾病控制中心等机构的研究团队Kingsley Andrew Egbe等人,对恩古和纳萨拉瓦州储存的67份HBV阳性样本展开研究。通过Qubit 4荧光仪和Nanodrop One分光光度计评估样本质量后,采用巢式PCR扩增S基因和P基因区域,最终对7份样本进行Sanger测序和系统发育分析。研究结果发表于《BMC Infectious Diseases》,揭示了该地区HBV的基因型特征和耐药突变谱。
关键技术方法包括:1)使用Qubit 4和Nanodrop One评估长期储存样本的DNA质量;2)巢式PCR靶向HBV S/P基因区域(引物见表1);3)Sanger测序结合GeneiousPrime进行系统发育分析;4)Geno2pheno(HBV)平台检测耐药突变。样本来源于先前发表的2项社区筛查研究(恩古州500人,纳萨拉瓦州500人)。
主要研究结果
样本特征与质量控制
67份HBV阳性样本中,7份通过质量检测(Qubit值1.65-10.32 ng/μL)。恩古州2份(1男1女,15-24岁),纳萨拉瓦州5份(4女1男,15-34岁)。
基因型分布
系统发育分析显示:恩古州2份均为基因型E;纳萨拉瓦州4份为E型,1份为A型(UNN/NAS/HBV/22/007)。基因型E占比85.7%,符合西非流行规律。
耐药突变分析
所有样本均未检出rtM204I/V/S等经典耐药突变,与尼日利亚既往研究一致。基因型E样本与部分参考序列存在聚类差异,提示潜在重组事件但未获验证。
讨论与意义
该研究首次系统报道纳萨拉瓦州HBV基因型特征,证实基因型E的绝对优势(85.7%),其快速传播可能与近代跨物种传播有关。未检出耐药突变的结果提示该地区一线核苷(酸)类似物(NA)治疗仍有效,但需警惕基因型E固有的高病毒载量和致癌风险。研究局限性包括样本量较小和未开展重组分析。
成果为西非HBV防控提供三点关键依据:1)基因型E的流行学证据支持精准筛查策略;2)长期储存样本的质量控制方案可推广至资源有限地区;3)需持续监测免疫逃逸突变(IEMs)和耐药突变(DRMs)。未来应扩大样本量并整合临床数据,以明确基因型E与肝细胞癌(HCC)的分子关联。
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