新型设计蛋白及其环状与镜像变体实现非手性小分子药物快速清除:计算工具赋能蛋白解毒剂的体内应用研究

【字体: 时间:2025年05月30日 来源:Nature Biomedical Engineering 27.7

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  小分子结合蛋白可中和毒素与细胞毒性药物,但体内行为不可预测及小分子免疫原性差限制抗体策略。本研究开发从头设计蛋白用于清除 FDA 批准药物,以阿哌沙班(apixaban)和芦卡帕利(rucaparib)为模型,通过镜像合成与环化增强稳定性,30 分钟内有效清除药物,证实计算工具结合药物化学策略的精准干预潜力。

  
小分子结合蛋白可中和毒素及细胞毒性药物,但其开发受限于不可预测的体内行为和小分子较差的免疫原性(这限制了基于抗体的方法)。在此,我们提出一种工程化从头设计蛋白的策略,用于在健康小鼠体内有效清除美国食品药品监督管理局(FDA)批准的药物。作为概念验证,我们设计了结合抗凝药物阿哌沙班(apixaban)的蛋白。由于阿哌沙班无手性,我们使用镜像合成和环化来增强设计蛋白的体内稳定性。两种蛋白变体均显示出有效活性,可在 30 分钟内促进阿哌沙班的快速清除。为评估该方法的广泛适用性,我们将分析扩展至靶向抗癌药物芦卡帕利(rucaparib)的从头设计蛋白,进一步证实其在小分子清除中的潜力。我们的研究表明,从头设计的小分子结合蛋白可在体内用作解毒剂,且计算工具可与药物化学策略结合以实现精准药理学干预。

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