跨癌种蛋白质组图谱：基于质谱技术的肿瘤生物学探索与生物标志物发现

来自国际团队的研究人员通过数据非依赖采集质谱(DIA-MS)技术，构建了首个覆盖22种癌症类型(18种实体瘤/4种液体瘤)的泛癌蛋白质组图谱(TPCPA)。该研究鉴定出9,670个蛋白质，揭示13个共表达模块及新型靶点(如HERC5/RNF5)，建立结直肠癌CMS分型的蛋白标志物，开发原发灶不明转移癌分类器，为PROTAC药物开发提供E3泛素连接酶资源。数据集已开放查询。

　　

这项突破性研究构建了迄今最全面的泛癌蛋白质组图谱(TPCPA)，采用高通量单次质谱技术分析了999例涵盖22种癌症类型(含4种血液肿瘤和18种实体瘤)的样本。研究团队鉴定出9,670个蛋白质分子，绘制出13个具有生物学意义的共表达网络模块，其中GFPT1、LRPPRC等意外枢纽蛋白展现出靶向治疗潜力。特别值得注意的是，研究者发现食管癌中高表达的HERC5和肝癌特异性RNF5等E3泛素连接酶，为开发蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC)疗法提供了关键分子线索。

在结直肠癌专项分析中，该研究首次在蛋白质层面验证了共识分子分型(CMS)的生物学基础，并鉴定出两个具有显著预后价值的免疫亚型。更引人注目的是，团队开发的多癌种分类算法能准确追溯原发灶不明的转移性肿瘤，这一突破为临床精准诊疗提供了新工具。所有数据均通过交互式网络平台开放共享，为全球癌症研究者提供了宝贵的资源宝库。