零售虾中产碳青霉烯酶细菌的意外高流行及blaNDM-1阳性希瓦氏菌属的广泛传播

为解决碳青霉烯类抗生素耐药性（NDM）在食品链中的传播风险，研究人员针对零售虾样本开展病原学调查，通过全基因组测序（WGS）和质粒分析，首次揭示44.2%样本携带blaNDM基因，且希瓦氏菌属（Shewanella spp.）为主要传播载体。该研究为食品安全监管提供关键数据，警示NDM通过质粒和克隆传播的公共卫生威胁。

　　

碳青霉烯类抗生素（Carbapenems）是人类对抗多重耐药菌感染的“最后防线”，但近年来，产碳青霉烯酶（Carbapenemase）的超级细菌在全球范围内扩散，其中新德里金属β-内酰胺酶（NDM）的传播尤为严峻。尽管NDM已在环境和临床样本中被广泛检出，但其在海鲜食品（尤其是全球消费量巨大的虾类）中的流行情况长期被忽视。这种知识空白可能导致潜在的食源性耐药菌传播风险被低估。

为填补这一研究缺口，来自中国的研究团队在《International Journal of Food Microbiology》发表了一项突破性研究。该团队从8个农贸市场采集77份非重复性虾样本，通过培养筛选和分子检测，发现34份样本（44.2%）携带bla_NDM阳性菌株。进一步的全基因组测序（WGS）和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF）鉴定显示，这些菌株以希瓦氏菌属（Shewanella）为主导，包括S. indica（9株）、S. chilikensis（12株）和S. algae（6株），同时检出6株河弧菌（Vibrio fluvialis）和5株大肠杆菌（Escherichia coli）。值得注意的是，希瓦氏菌和河弧菌表现出高度遗传同源性，提示虾类中存在克隆传播现象。

研究团队采用纳米孔测序（Nanopore）对11株代表性菌株的质粒进行分析，发现10个bla_NDM基因位于质粒上，包括IncC型（2株）、无法分型的希瓦氏菌专属质粒（5株），以及来自大肠杆菌的IncI1、IncHI2和IncFII-FIA型质粒。这些质粒与GenBank数据库中的其他来源质粒具有高度同源性，而希瓦氏菌的无法分型质粒则展现出独特的遗传特征。

主要技术方法
研究通过以下关键技术实现突破：1）虾样本的bla_NDM基因筛查与菌株分离；2）MALDI-TOF和WGS进行物种鉴定与基因组分析；3）纳米孔测序解析质粒结构；4）生物信息学比对揭示质粒传播规律。样本来源于中国农贸市场的零售虾。

研究结果

1. 高流行率与菌种分布：44.2%的虾样本携带bla_NDM阳性菌，希瓦氏菌属占主导（71.1%）。
2. 克隆传播证据：希瓦氏菌与河弧菌的基因组高度相似，表明虾类中存在局部克隆扩散。
3. 质粒介导的传播机制：bla_NDM主要位于可移动质粒上，且与跨宿主传播的质粒类型（如IncC）相关。
4. 希瓦氏菌专属质粒：无法分型的质粒可能代表新的NDM传播载体。

结论与意义
该研究首次证实零售虾是NDM阳性菌的重要储存库，希瓦氏菌属作为主要携带者通过质粒和克隆传播加剧了耐药基因扩散风险。这一发现不仅揭示了食品链在抗生素耐药性传播中的关键作用，更为制定针对水产食品的NDM监测政策提供了科学依据。研究者强调，亟需建立从养殖到零售的全链条NDM防控体系，以阻断耐药基因通过食物链向人类传播的潜在路径。