汞离子介导的DNA自双链体稳定性研究:基于单分子蛋白质纳米孔传感技术的胸腺嘧啶位置与数量效应分析

【字体: 时间:2025年05月30日 来源:Biosensors and Bioelectronics 10.7

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  本研究通过单分子纳米孔电生理技术,首次揭示了Hg2+可稳定无法常规杂交的DNA自双链体。团队设计含不同数量/位置胸腺嘧啶(T)的DNA片段,发现中央T-Hg2+-T配对的双链易解旋,而末端配对的则展现显著刚性。该发现为开发无标记纳米孔金属离子传感器和DNA自识别技术提供新思路。

  

在生命科学领域,金属离子与DNA的相互作用一直是研究热点。汞(Hg)作为剧毒重金属,不仅能与DNA直接结合形成胸腺嘧啶-汞-胸腺嘧啶(T-Hg2+-T)非经典碱基对,还可能影响基因表达和DNA构象。尽管前人通过紫外吸收、荧光光谱等技术研究了金属-DNA相互作用,但传统方法难以在单分子水平实时观测动态过程。特别是在DNA自组装和纳米传感器开发领域,精确控制T-Hg2+-T配对的稳定性仍面临挑战。

为探究这一科学问题,研究人员采用α-溶血素(α-HL)纳米孔单分子检测技术,设计了两组不同T分布特征的15nt DNA片段:ssDNA_1(TAGTGTTGCTATCAC)和ssDNA_2(ATCACCGT CGTAGTT)。通过系统改变Hg2+浓度(0-175μM),在0.5M KCl缓冲体系中进行纳米孔电生理实验,记录DNA与纳米孔相互作用的电流信号特征。关键技术包括:脂质双分子层构建、单通道电流记录(Axopatch 200B放大器)、事件 dwell time 分析等。

研究结果部分,3.1章节显示:含中央T-Hg2+-T的DNA_1双链体(4个T-Hg2+-T+2个C-G)在100μM Hg2+下停留时间达193.16ms,比无汞时提高134倍。电流阻断分析(ΔI/I0=0.933)证实其易从松散末端解旋,符合"分子拉链"模型。而3.2章节发现:含末端T-Hg2+-T的DNA_2双链体(3个T-Hg2+-T+6个C-G+2个A-T)呈现"软木塞"效应,在+140mV电压下仅16.27ms停留但完全阻塞孔道(ΔI/I0=0.841),电压升高时阻塞时间反而延长,表明其结构刚性显著增强。

结论部分指出,T-Hg2+-T配位化学具有显著位置效应:中央配位促进动态重组,适合传感器开发;末端配位增强结构刚性,适用于分子焊接。该工作发表于《Biosensors and Bioelectronics》,不仅为重金属检测提供新方法,更揭示了核酸自组装工程的精确调控原理,在环境监测、DNA纳米技术和基因诊断等领域具有重要应用价值。特别是通过单分子技术直观比较不同构型能量景观的创新方法,为后续金属核酸化学研究建立了范式。

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