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微生物操纵对糖海带(Saccharina latissima)宿主功能核心影响的实验验证
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月30日 来源:Applied and Environmental Microbiology 3.9
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本研究通过实验验证了"核心微生物组影响宿主功能"假说(CIHF),揭示了糖海带(Saccharina latissima)核心菌群(如Maribacter、Litorimonas等)在宿主发育中的关键作用。作者整合16S rRNA测序与共培养实验,首次证实野生海带核心菌群(IndVal>0.7)与实验室条件下促进配子体定植(log2FC↑)和孢子体发育的菌株呈正相关(P=0.00051),为海藻养殖的微生物调控提供了理论框架。
微生物与海带的共生密码:从生态关联到应用突破
ABSTRACT
糖海带作为重要的经济藻类,其微生物组在营养交换和抗病中发挥关键作用。研究通过"核心微生物组影响宿主功能"假说(CIHF)框架,发现野生糖海带核心菌群(Persicirhabdus、Maribacter等8个属)在养殖环境中逐渐定植,且其生态关联强度(IndVal值)与促进宿主发育能力显著正相关(P<0.05)。
INTRODUCTION
全球海藻养殖面临气候变化和病害压力,而微生物操纵(如添加植物促生菌)在农业中已有成功案例。糖海带养殖周期中,育苗阶段微生物控制成本高昂,但完全灭菌会导致发育异常——如无菌培养的Laminaria无法成熟。核心菌群假说认为稳定关联的微生物更可能影响宿主,但缺乏实验证据。
RESULTS
野生糖海带的细菌分布
跨时空采样(4个站点×12个月)显示海带菌群显著区别于环境(PERMANOVA R2=0.196),但存在稳定核心菌群。通过IndVal分析(阈值>0.7)鉴定出8个核心属和12个ASV,如Maribacter ASV2在90%样本中存在。
养殖与野生菌群差异
养殖幼苗核心菌群缺失,但出海移植6个月后逐渐定植。Bamfield站点12月龄养殖海带已完全获得野生型核心菌群,证实环境获取机制。
共培养实验验证功能
101株分离菌(含3个核心属)与海带孢子共培养显示:33株显著促进配子体覆盖(如Maribacter M16使孢子体数量log2FC↑2.1),5株抑制发育。关键发现:菌属IndVal值与促进孢子体产量显著正相关(F=13.00, P=0.00051)。
IAA生产的生态意义
59%分离菌产生长素IAA,且产IAA菌株更倾向与海带强关联(t-test P=0.0002),但IAA产量与促生长效果无直接关联,暗示其他调控机制如Maribacter产生的thalassin形态发生素可能起效。
DISCUSSION
研究首次实验验证CIHF假说,揭示核心菌群通过水平传播机制维持与宿主的互作。尽管存在功能冗余(如多属产IAA),核心菌群如Maribacter仍表现出稳定的促生长特性。该成果为海藻养殖的微生物接种技术奠定基础,建议未来研究多菌株组合接种策略。
MATERIALS AND METHODS
创新性地结合:1)跨季节野生菌群监测(Sterivex过滤+拭子采样);2)梯度培养基分离(含海带组织的Difco培养基获得稀有菌);3)96孔板高通量共培养系统(标准化接种1×107 cells/mL);4)显微动态监测(配子体覆盖率量化)。测序采用V4区16S rRNA引物515F/806R,经DADA2流程处理。
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