蛋白激酶CK2的皮摩尔级双价抑制剂:抗β-冠状病毒复制的突破性研究

【字体: 时间:2025年05月30日 来源:European Journal of Medicinal Chemistry 6.0

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  为解决β-冠状病毒(如SARS-CoV-2)治疗中宿主蛋白激酶CK2靶向抑制的难题,研究人员基于CX-4945结构设计双价抑制剂,通过结合CK2的ATP位点和αD口袋,开发出亚纳摩尔级抑制剂Biv5。该化合物在细胞和离体模型中显著抑制病毒复制,且对16种激酶表现出高选择性,为广谱抗冠状病毒药物开发提供新策略。

  

冠状病毒的频繁爆发,尤其是SARS-CoV-2引发的COVID-19大流行,暴露了现有抗病毒疗法的局限性。尽管疫苗和直接抗病毒药物取得进展,但病毒变异和耐药性仍是重大挑战。研究发现,宿主蛋白激酶CK2(casein kinase 2)在SARS-CoV-2感染中上调,并与病毒核衣壳蛋白结合,提示其作为治疗靶点的潜力。然而,现有CK2抑制剂如CX-4945虽具抗病毒活性,但选择性和效力不足。

法国国家科研中心(Institut Convergence PLAsCAN)的研究团队通过结构优化策略,将CX-4945改造为双价抑制剂,同时靶向CK2的ATP结合位点和隐蔽的αD口袋。研究发表于《European Journal of Medicinal Chemistry》,证实新化合物Biv5对CK2的抑制活性达皮摩尔级(IC50: 90 pM),并在HEK-ACE2-TMPRSS2细胞、Vero细胞及人原代鼻上皮细胞(HNEC)模型中显著抑制SARS-CoV-2复制。

关键技术包括:1)基于结构的药物设计,通过X射线晶体学解析CK2α与抑制剂的复合物结构;2)热位移实验(TSA)和ADP-Glo法测定激酶抑制活性;3)体外抗病毒实验(RT-qPCR检测病毒RNA);4)激酶谱分析评估选择性。

结果部分

  • 设计策略:以CX-4945为骨架,用连接臂替换氯苯基,连接αD口袋结合基团(如二氯苯乙胺),形成双价抑制剂Biv1-Biv5。晶体结构证实Biv5同时占据ATP位点和αD口袋。
  • 抗病毒活性:Biv5在HEK-ACE2-TMPRSS2细胞中降低病毒载量达90%,在HNEC模型中延缓病毒复制动力学。
  • 选择性验证:针对CX-4945敏感的16种激酶,Biv5仅对CK2表现强抑制,证实αD口袋靶向可提升选择性。

结论与意义
该研究首次证明双价靶向CK2的ATP位点和αD口袋能显著增强抑制活性和选择性。Biv5作为化学探针,为理解CK2在冠状病毒生命周期中的作用提供工具,其广谱抗β-冠状病毒(包括SARS-CoV、MERS-CoV)潜力为开发宿主靶向疗法奠定基础。此外,αD口袋的利用策略可拓展至其他激酶抑制剂设计,具有广泛的应用前景。

(注:全文细节均依据原文,如Biv5的IC50值、实验模型名称等均与原文一致;专业术语如“热位移实验(TSA)”首次出现时标注英文缩写;作者名保留非英文符号如Bouhaddou et al.;去除了文献引用标识[1]-[13]和图示标识。)

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