环状RNA circ-BRIP1/circ-EPHB4在伊马替尼耐药胃肠道间质瘤中的分子机制及临床价值研究

本研究针对胃肠道间质瘤(GIST)患者对一线药物伊马替尼(imatinib)耐药的关键难题，通过ceRNA芯片和FFPE组织微阵列(TMA)技术，首次揭示了circ-BRIP1和circ-EPHB4及其宿主基因在耐药GIST中的高表达特征。研究人员发现这些分子与肿瘤复发、转移显著相关，并创新性开发了circRNA原位杂交-免疫组化(ISH-IHC)技术用于临床检测。该成果为耐药GIST的分子诊断提供了新靶点，发表于《Journal of Translational Medicine》，具有重要转化医学价值。

　　

胃肠道间质瘤(GIST)作为最常见的消化道间叶源性肿瘤，其治疗领域长期面临一个严峻挑战：尽管酪氨酸激酶抑制剂(TKI)伊马替尼(imatinib)能显著改善患者预后，但约50%患者会在用药6个月后出现继发性耐药，导致肿瘤复发和转移。这种耐药机制复杂多样，从KIT/PDGFRA基因二次突变到表观遗传调控异常均有涉及，但环状RNA(circRNA)在其中的作用始终是未解之谜。

复旦大学附属中山医院的研究团队在《Journal of Translational Medicine》发表的重要研究，首次系统描绘了耐药GIST的circRNA表达图谱。通过整合ceRNA芯片、qRT-PCR验证和大样本组织微阵列(TMA)分析，研究人员不仅鉴定出关键circRNA分子标志物，更开创性地将circRNA原位杂交技术应用于临床样本的高通量检测，为破解GIST耐药难题提供了新视角。

研究采用三大关键技术：1）对3对耐药/敏感GIST样本进行SBC人类ceRNA芯片筛查；2）在204例患者队列（100例初治/104例耐药）中通过qRT-PCR验证候选circRNA；3）利用包含150例FFPE样本的组织微阵列开展ISH-IHC和免疫组化分析。

RNA谱分析与功能通路
ceRNA芯片揭示521个差异表达circRNA（219上调/302下调）和107个mRNA（87上调/20下调）。KEGG分析显示DNA复制、错配修复等通路激活，而circRNA宿主基因富集于细胞周期和脂肪酸代谢通路。特别值得注意的是，BRIP1、EPHB4和RECQL4在GSE155800和本研究数据集共同上调。

关键circRNA的验证
在验证队列中，circ-EPHB4在68.8%耐药样本中表达升高49.8倍（p=0.001），其宿主基因EPHB4在50%耐药样本中上调3.44倍。circ-BRIP1和BRIP1分别在74%和52%耐药样本中显著高表达（7.25倍和274.53倍）。独立测试队列进一步证实这些分子在耐药组的过表达特征（如circ-RECQL4升高28.09倍）。ROC曲线显示联合检测AUC达0.908。

组织微阵列的临床关联
ISH-IHC技术首次在TMA中实现circRNA可视化：EPHB4在低分化GIST中强烈表达（p<0.05），且与耐药显著相关。Kaplan-Meier分析显示高表达circ-BRIP1患者中位生存期缩短20个月（71.54 vs 91.26月，p=0.009）。核异型性和高有丝分裂指数（>10/50 HPF）与这些分子表达呈正相关。

这项研究开创性地建立了circRNA在GIST耐药中的分子框架：1）circ-BRIP1/circ-EPHB4可作为新型耐药标志物；2）其宿主基因EPHB4与肿瘤恶性程度分级相关；3）开发的ISH-IHC-TMA技术为circRNA临床检测提供标准化方案。这些发现不仅为理解GIST耐药提供了ceRNA调控网络的新视角，更为个体化治疗策略开发奠定了分子基础。值得注意的是，EPHB4在多种癌症中促进血管生成的特性，提示其可能成为跨瘤种的治疗靶点。未来研究需进一步阐明这些circRNA在KIT信号通路中的具体作用机制，以及其作为液体活检标志物的潜在价值。