香港分离的甲苯降解菌株Gulosibacter sp. ACHW.36C全基因组测序及降解机制解析

【字体: 时间:2025年05月31日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.7

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  研究人员从香港马匹护理海绵中分离出一株新型甲苯降解菌Gulosibacter sp. ACHW.36C,通过Illumina-Nanopore混合组装获得2.74 Mb完整基因组(67.61% G+C),发现其携带苯乙酸(paa)代谢簇和儿茶酚2,3-双加氧酶(hpaD)基因,为环境污染物生物修复提供新资源。

  

在环境微生物研究领域,一株具有特殊降解能力的细菌Gulosibacter sp. ACHW.36C从香港马场被石油基蹄油污染的清洁海绵中脱颖而出。这株菌在含150 μL甲苯的LB培养基中展现出强劲生长能力,经Bushnell-Haas培养基验证其能以甲苯为唯一碳源。

科研人员采用Illumina MiSeq/NovaSeq与Oxford Nanopore MinION双平台测序,通过Trimmomatic和Porechop数据清洗后,利用Unicycler混合组装获得环形染色体(2,748,452 bp)。CheckM评估显示基因组完整度达99.23%,携带2447个编码基因和46个tRNA。与近缘种Gulosibacter sediminis PS01859的ANIb值为91.44%。

该菌的降解能力可能源于两个关键通路:位于M3M28_01580的儿茶酚2,3-双加氧酶(EC 1.13.11.2),以及包含13个基因的苯乙酸(paa)代谢簇(M3M28_07130-07190)。特别值得注意的是,paa基因簇呈现独特的双向转录布局——仅中央的paaIKR基因与dnaA同向转录,这种结构特征与Martin和McInerney报道的经典模型相呼应。

基因组分析还揭示其含有2套完整的5s-16s-23s rRNA操纵子,GC含量高达67.61%,这些特征为理解Microbacteriaceae科细菌的环境适应性提供了新线索。该菌株的发现不仅拓展了Gulosibacter属的生态功能认知,更为石油烃污染的生物治理提供了潜在候选菌种。

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