中国群养猫中新型猫杯状病毒基因组的发现及其分子进化研究

针对猫杯状病毒(FCV)疫苗交叉保护不足的难题，江苏省农业科学院团队通过分子流行病学研究，在中国常州群养猫中发现新型基因群G III，揭示其与G I的重组事件及抗原差异，为多价疫苗设计提供关键依据。研究成果发表于《Scientific Reports》。

　　

猫杯状病毒(FCV)作为猫上呼吸道疾病的主要病原体，其高变异性和疫苗保护不足问题长期困扰兽医领域。尤其在动物收容所等高密度环境中，尽管使用含FCV-255株的三联灭活疫苗，疫情仍频繁暴发。更棘手的是，强毒株VS-FCV可突破疫苗防线引发致死性全身疾病(VSD)。中国作为全球宠物猫数量最多的国家之一，FCV流行株的遗传特征却鲜有系统研究，这为疫苗研发和疾病防控带来巨大挑战。

江苏省农业科学院兽医研究所联合多家单位，对2024年常州某收容所暴发的FCV疫情展开研究。团队从15只出现临床症状的接种疫苗猫中分离病毒，通过全基因组测序、系统发育分析和重组鉴定等技术，首次报道了新型基因群G III的发现及其与主流G I株的抗原差异。论文发表于《Scientific Reports》杂志。

研究采用的关键技术包括：1) 从鼻拭子样本中分离病毒并使用CRFK细胞培养；2) 间接免疫荧光法(IFA)鉴定病毒；3) VP1基因全长扩增与测序；4) 使用MEGA 6.0构建系统发育树；5) RDP4和SimPlot软件进行重组分析；6) 血清中和试验评估交叉保护性。

病毒分离
成功分离15株FCV（命名为FCVCatCZ3-2024至FCVCatCZ17-2024），TCID₅₀介于10^-7.67至10^-8.5/mL，IFA验证所有毒株均表达VP1蛋白。

系统发育分析
基于VP1序列的进化树显示：13株属G I，形成两个新亚群（Cluster VI和VII）；2株（FCVCatCZ10/14-2024）与9个中国分离株构成独立分支G III。G III株在VP1蛋白377N、539A（G I特征）和557S（G II特征）位点呈现独特组合，证实其分类地位。

重组事件
发现FCVCatCZ6-2024为G I与G III的重组体，断点位于VP1基因118 bp处：5'端源自G III株FCVCatCZ14，剩余部分继承G I株FCVCatCZ4的序列。这是首例G I/G III重组报道。

抗原差异
中和试验显示：G I感染猫血清对同源株中和效价（IC₅₀）显著高于对G III株（p<0.01），反之亦然。接种疫苗但未感染猫的血清对所有测试株效价均低下，揭示现行疫苗对G III保护有限。

该研究首次系统揭示了中国群养猫中FCV的复杂进化图景：G III作为新基因群的崛起、G I/G III重组事件的发生，以及由此产生的抗原多样性。尤为关键的是，VP1蛋白CDE区（中和表位主要区域）的变异直接导致疫苗交叉保护失败。这些发现不仅解释了疫苗接种后仍暴发疫情的原因，更指明未来疫苗设计需包含G III株抗原成分。

研究同时提出重要预警：高密度饲养环境加速了FCV的变异与重组，G III可能通过获得G I的毒力相关基因（如诱导细胞凋亡的LC蛋白）增强致病性。这为制定"环境-病毒-宿主"三位一体的防控策略提供了分子基础，对全球FCV流行病学研究具有里程碑意义。