mNGS技术在呼吸道感染病原体诊断中的临床价值：一项400例患者的回顾性研究

本研究针对下呼吸道感染(LRTIs)病原体诊断难题，采用宏基因组下一代测序(mNGS)技术对400例患者支气管肺泡灌洗液(BALF)样本进行分析。结果显示：mNGS灵敏度达93.3%，显著高于传统培养法(55.6%)，可检出肺炎链球菌、耶氏肺孢子菌等难培养病原体；50.5%患者依据mNGS结果调整抗生素方案，60.8%获得治疗响应。该研究为精准抗感染治疗提供了新策略。

　　

下呼吸道感染(LRTIs)是全球传染病致死的主要原因，但传统病原体检测方法面临培养周期长、灵敏度低等瓶颈。临床常需经验性使用广谱抗生素，导致耐药性加剧。南昌大学第一附属医院的研究团队通过400例回顾性研究，系统评估了宏基因组下一代测序(mNGS)在LRTIs诊断和抗生素管理中的价值。

研究采用BALF样本同步进行mNGS和培养检测。关键技术包括：玻璃珠机械破碎法提取核酸、Illumina NextSeq-550Dx测序平台、GRCh38人源序列去除、微生物基因组数据库比对。通过ROC曲线比较诊断效能，并分析基于mNGS的抗生素调整策略。

主要结果

1. 诊断性能对比：mNGS灵敏度(93.3% vs 55.6%)和阴性预测值(63.9% vs 25.9%)显著优于培养法，但特异性较低(54.9% vs 71.8%)。AUC值0.744显示其更优的鉴别能力。

2. 病原谱差异：mNGS额外检出肺炎链球菌(7.0% vs 0%)、耶氏肺孢子菌(11.9% vs 0%)等28例结核分枝杆菌和25例鹦鹉热衣原体，揭示传统方法易漏诊的胞内病原体。

3. 治疗影响：166例(50.5%)根据mNGS调整方案，包括70例降阶梯治疗、76例升阶梯治疗（27例抗真菌、20例抗病毒），60.8%患者获得临床改善。

讨论与意义
该研究证实mNGS可突破传统检测的三大局限：覆盖难培养病原体、缩短诊断时间、指导精准用药。特别对免疫抑制患者合并耶氏肺孢子菌、结核分枝杆菌等感染具有独特价值。但需注意其特异性不足可能导致假阳性，建议结合临床判断。研究成果为《Scientific Reports》提供了LRTIs诊断的新范式，推动感染性疾病进入"组学时代"的精准诊疗。