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基于布朗桥扩散模型的像素超分辨率虚拟染色技术实现无标记组织的高保真成像
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月31日 来源:Nature Communications 14.7
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针对传统深度学习虚拟染色方法在分辨率与稳定性上的局限,加州大学洛杉矶分校Aydogan Ozcan团队开发了基于布朗桥扩散模型(BBDM)的像素超分辨率虚拟染色技术。该研究通过采样过程工程(mean/skip sampling)将无标记组织自发荧光图像转换为空间分辨率提升4-5倍(空间带宽积提高16-25倍)的H&E染色等效图像,在结构相似性(SSIM)和感知精度(LPIPS)指标上显著优于cGAN方法,为临床病理诊断提供了更可靠的数字染色方案。
在临床病理诊断中,组织化学染色如苏木精-伊红(H&E)染色是金标准,但存在耗时耗材、组织损伤等问题。虽然基于生成对抗网络(cGAN)的虚拟染色技术已取得进展,但在处理低分辨率自发荧光(AF)图像时面临分辨率不足和输出不稳定的双重挑战。特别是在像素超分辨率(指通过算法提升图像有效像素数量而非突破光学衍射极限)任务中,传统方法难以同时保证染色准确性和结构保真度,这严重制约了数字病理学的临床应用。
针对这一技术瓶颈,加州大学洛杉矶分校的Yijie Zhang、Luzhe Huang等研究人员在《Nature Communications》发表创新成果,提出基于布朗桥扩散模型(Brownian Bridge Diffusion Model, BBDM)的像素超分辨率虚拟染色框架。该研究通过独特的采样过程工程技术,首次实现了无标记组织图像在提升空间分辨率的同时完成高保真虚拟染色,为计算病理学开辟了新范式。
研究团队采用多模态显微成像技术获取人肺和心脏组织的自发荧光图像(DAPI/TxRed/Cy5通道)及对应的H&E染色 ground truth,通过弹性金字塔配准算法实现像素级对齐。关键技术包括:1)构建基于注意力机制U-Net的降噪网络,通过布朗桥过程建模条件扩散;2)开发均值采样(mean sampling)和跳跃采样(skip sampling)策略,在反向采样过程中优化退出点te以降低方差;3)采用后采样平均策略进一步抑制输出波动;4)通过迁移学习验证模型在心脏组织的泛化能力。
【像素超分辨率虚拟染色性能】
通过系统比较不同超分辨率因子(1x-5x)下的虚拟染色效果,研究发现BBDM模型(Dx)在2x-5x超分辨率时SSIM值显著高于cGAN模型(Gx),尤其在肺组织炭末沉着(anthracotic pigment)等关键病理特征重建上优势明显。频率谱分析显示虚拟染色图像的空间频谱与真实H&E染色高度吻合,证实其有效提升了空间带宽积(Space-Bandwidth Product)。
【扩散采样工程优化】
对比三种采样策略发现,均值采样在te=50时取得最佳平衡,其SSIM(0.712±0.003)接近5次平均的普通采样(0.719±0.002),但推理时间仅为其1/5。变异系数(CV)分析表明,均值采样结合5次平均可使色度通道(Cb/Cr)的CV降至0.5%以下,极大提升了临床所需的输出稳定性。
【跨器官验证】
通过迁移学习将肺组织模型适配到心脏组织后,DxH模型成功重建心肌横纹(intercalated discs)等细微结构,SSIM指标在不同超分辨率因子间无统计学差异(p>0.05),证实该方法具有优异的器官泛化能力。
这项研究开创性地将扩散模型应用于组织虚拟染色领域,其技术突破主要体现在三方面:1)首次实现像素超分辨率与虚拟染色的协同优化,突破传统方法的分辨率限制;2)通过采样过程工程解决扩散模型固有的输出波动问题,使CV值降低一个数量级;3)建立器官间可迁移的通用框架,仅需少量样本即可适配新组织类型。该技术不仅免除了化学染色的繁琐流程,更通过提升图像分辨率使病理学家能观察到更细微的组织结构特征,对加速精准医疗发展具有重要意义。未来,该方法可进一步拓展至癌症组织分析等领域,为智能病理诊断系统提供更强大的技术支持。
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