Nature Medicine：多组学分析指导黑色素瘤的治疗

　　

近年来，由于采用了有效的标准治疗（SOC），恶性黑色素瘤的预后得到了显著改善。然而，许多黑色素瘤患者的病情仍会复发或进展。这些患者的临床管理面临着重大挑战。

瑞士苏黎世大学等机构领导的一项精准肿瘤学研究表明，单细胞多组学分析和功能分析有望为黑色素瘤的治疗或管理提供新的见解。

这篇题为“Feasibility of multiomics tumor profiling for guiding treatment of melanoma”的论文于5月27日发表在《Nature Medicine》杂志上。

在瑞士几家医院开展的Tumor Profiler（TuPro）项目是一个前瞻性的非随机观察项目，旨在评估功能分析和单细胞多组学数据与分子肿瘤专家组（MTB）决策的相关性。

作为TuPro项目的一部分，研究人员此次对116名黑色素瘤患者的126份样本开展了一整套的功能分析和多组学分析。

研究人员利用“快速诊断循环”，对参与者的肿瘤样本开展了九种功能分析和多组学分析，包括单细胞DNA测序、单细胞RNA测序、批量细胞DNA测序、数字病理学、基于成像质谱流式（IMC）和CyTOF的蛋白质组学、蛋白质分型、药物分型和迭代间接免疫荧光成像。

“选择这些技术的依据是它们能够提供每个肿瘤的全面分子画像，具有潜在的临床意义，”作者解释说。“每个样本生成和评估的数据多达500 Gb，相当于4万多个潜在的治疗决策标志物。”

在已确定和实验性标志物中，分子肿瘤专家组选择了54个标志物，这些标志物被证明有助于指导黑色素瘤的治疗决策。在75%的病例中，基于TuPro的数据被认为有助于提供治疗建议。

患者要么接受标准治疗（SOC），要么接受多个标志物驱动的高度个性化治疗（beyond SOC）。研究人员可利用TuPro图谱来比较两类患者的结局。

他们统计了37名患有难治肿瘤的beyond SOC患者的客观缓解率，结果显示疾病控制率为54%，客观缓解率为38%。

同样地，研究人员记录到，根据TuPro信息做出治疗决策的患者的无进展生存期为6.04个月，不过接受≥三线治疗的患者的无进展生存期略有下降，仅为5.35个月。

特别值得注意的是，研究人员证明仅需3-4种关键技术（NGS、药物分型、IMC或scRNA-seq）组合即可覆盖97%患者的标志物检测需求，将单样本成本控制在临床可接受范围。

总的来说，TuPro项目的概念证明研究表明了基于多组学的肿瘤图谱分析在临床决策方面的可行性和相关性。这些发现为精准肿瘤学的实际应用提供了重要范式，也为后续随机对照试验的设计奠定了基础。