3',4'-二甲氧基黄酮醇(F34)作为SARS-CoV-2主蛋白酶(Mpro)抑制剂的计算机模拟设计与评价

研究人员通过Flynn-Algar-Oyamada反应合成3',4'-二甲氧基黄酮醇(F34)，采用MOE 2022.02软件对SARS-CoV-2主蛋白酶(PDB ID: 6M2N)进行分子对接，结合药效团分析和分子动力学(MD)模拟验证其抑制潜力。结果显示F34以-8.42 kcal/mol结合自由能稳定结合催化残基His41/Cys145，与Gly143/His164形成<2.9 ?氢键，为抗新冠病毒药物开发提供新候选。

　　

黄酮类化合物因其广谱生物活性备受关注，其中抑制SARS-CoV-2的潜力尤为突出。本研究聚焦3',4'-二甲氧基黄酮醇(F34)的合成与抗病毒机制探索，通过经典的Flynn-Algar-Oyamada反应以75.23%收率获得目标化合物，并经¹H-NMR、FT-IR和UV-Vis光谱确证结构。

借助MOE 2022.02软件，团队对SARS-CoV-2主蛋白酶(M^pro，PDB 6M2N)展开分子对接研究。令人振奋的是，F34展现出-8.42 kcal/mol的强结合自由能，其分子结构精准嵌入酶活性口袋：不仅与关键催化二元体His41/Cys145发生相互作用，更与Gly143和His164形成稳定的氢键网络。分子动力学(MD)模拟进一步揭示，F34与Gly143/His164的氢键距离始终维持在2.9 ?以内，结合构象的RMSD值低至1.03，彰显出卓越的结合稳定性。

这些发现为抗新冠病毒药物研发注入新思路——F34通过双重作用机制（阻断催化中心+稳定次级相互作用）高效抑制病毒复制，其独特的二甲氧基修饰可能成为后续结构优化的关键药效团。