综述:多组学技术在水产遗传育种中的作用:现状与未来展望

【字体: 时间:2025年06月01日 来源:Science China Life Sciences 8

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  (编辑推荐)本综述系统阐述多组学(multi-omics)技术如何推动水产育种革新,涵盖基因组选择(GS)、SNP标记筛选及基因编辑(如CRISPR)应用,强调人工智能(AI)整合多组学数据提升表型预测精度,为培育高产抗逆品种提供新范式。

  

Abstract

水产养殖作为增长最快的食品生产领域,其可持续发展亟需遗传育种技术的突破。传统选择育种通过累加效应改良经济性状,而多组学技术的融合正重塑育种范式——从基因组(genomics)、转录组(transcriptomics)到表观组(epigenomics)数据的整合,显著提升了单核苷酸多态性(SNP)标记的筛选效率,为基因组选择(GS)提供了分子层面的决策依据。

多组学驱动的育种革新

当前研究聚焦于将功能基因组数据嵌入传统GS模型,例如通过代谢组(metabolomics)数据解析抗病相关通路(如Toll样受体信号通路),或利用染色质开放组(ATAC-seq)定位调控经济性状的关键顺式元件。深度学习模型(如CNN、Transformer)在跨组学数据关联分析中展现出强大潜力,可精准预测生长速度或耐盐性等复杂性状。

基因编辑的产业化潜力

CRISPR-Cas9技术不仅能修复养殖物种的有害等位基因,还可通过等位基因渐渗(allele introgression)将野生种群的优良变异(如抗白斑病基因WSSVres)引入育种体系。更前沿的
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