综述:谷氨酸棒状杆菌合成芳香族化合物的工程改造

【字体: 时间:2025年06月01日 来源:Applied Microbiology and Biotechnology 3.9

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  该综述聚焦谷氨酸棒状杆菌(C. glutamicum),阐述其通过代谢工程改造,利用莽草酸途径(shikimate pathway)生产芳香族化合物,涵盖中间体、氨基酸、酚类及聚酮类等,还提及面临挑战与优化方向,为生物合成领域提供参考。

  

谷氨酸棒状杆菌在芳香族化合物合成中的代谢工程进展


引言


芳香族化合物在工业中应用广泛,当前多数通过化石资源化学合成,面临环境问题。微生物合成作为可持续替代方案备受关注,谷氨酸棒状杆菌(C. glutamicum)因对芳香族化合物耐受性高、遗传操作工具成熟等优势,成为重要平台。其可通过莽草酸途径合成芳香族化合物,还能通过异源或合成途径生产高价值天然产物如植物多酚、聚酮类等。

莽草酸途径中间体及芳香族氨基酸生产


莽草酸途径始于磷酸烯醇式丙酮酸(PEP)和赤藓糖 - 4 - 磷酸(E4P)缩合生成 3 - 脱氧 - D - 阿拉伯庚酮糖酸 - 7 - 磷酸(DAHP),经系列反应生成分支酸(CHO),进而合成芳香族氨基酸(苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸)及叶酸、泛醌 - 10 等。

  • 莽草酸(SA):作为抗流感药物达菲前体,通过筛选莽草酸途径前四个酶的组合、敲除莽草酸激酶基因(aroK)等改造,菌株在高密度静止细胞发酵中可积累高达 141 g/L SA。
  • 邻氨基苯甲酸(ANT):是色氨酸合成前体,敲除 trpD 基因阻断色氨酸合成,同时敲除 qsuB、qsuD 基因消除竞争途径,通过启动子替换、表达反馈抗性 DAHPS 等优化,菌株在补料分批培养中积累 26.4 g/L ANT。
  • 芳香族氨基酸:苯丙氨酸(PHE)生产通过过表达莽草酸途径及糖代谢基因、敲除转运蛋白基因(aroP)等,菌株积累 15.6 g/L PHE;色氨酸(TRP)生产通过敲除分支酸变位酶基因(csm)、优化 trp 操纵子等,菌株积累 2.11 g/L TRP;酪氨酸(TYR)生产通过改造途径分支点基因起始密码子,菌株在葡萄糖 - 木糖混合碳源中积累 3.6 g/L TYR。

莽草酸途径衍生化合物生产


  • 原儿茶酸(PCA):可通过 DHS 脱水或 4 - 羟基苯甲酸(4HB)羟化生成。敲除降解途径基因、优化前体供应等改造,菌株在生长解偶联条件下积累 9.5 g/L PCA,同时利用两条途径的菌株可积累 82.7 g/L PCA。
  • 羟基苯甲酸:2 - 羟基苯甲酸(2HB)通过异源表达异分支酸合酶(ICS)合成;3 - 羟基苯甲酸(3HB)通过表达 3 - 羟基苯甲酸合酶(Hyg5)合成;4HB 通过表达分支酸裂解酶(UbiC)合成,优化后菌株积累 36.6 g/L 4HB。
  • 芳香族醛类:4 - 羟基苯甲醛(4HBAL)生产通过敲除具有还原酶活性的 NCgl0324 基因,积累 1.36 g/L;香草醛(VAN)通过筛选羧酸还原酶(CAR),在生物转化中实现 21 g/L 香草酸转化为 VAN。
  • 其他化合物:对氨基苯甲酸(PABA)通过异源表达 ADS、ADL 基因合成,菌株积累 43 g/L PABA;4 - 氨基 - 3 - 羟基苯甲酸(4AHB)通过改造 PABA 羟化酶合成,积累 13.5 g/L;甲基 anthranilate(MANT)通过引入 anthranilic acid methyltransferase(ANTM)及增强 SAM 供应合成,积累 5.74 g/L;吲哚(IND)通过利用色氨酸合成酶 α 亚基或色氨酸酶(TN)合成,结合原位产物回收,积累 5.7 g/L IND。

(多)酚类及芳香族聚酮类生产


植物多酚如 stilbenoids、flavonoids 等以苯丙素类为前体,通过聚酮合酶(PKSs)合成。构建敲除芳香族化合物降解基因的平台菌株,异源表达 4 - 香豆酸 - CoA 连接酶(4CL)、 stilbene synthase(STS)等,可生产白藜芦醇(RES)、柚皮素(NAR)等。通过抑制脂肪酸合成酶增加丙二酰 - CoA 供应,或改造代谢增强丙二酰 - CoA 可用性,提升多酚产量。此外,还可通过甲基化、羟基化修饰多酚结构,生产更高价值化合物如紫檀芪。利用双相萃取策略(如 tributyrin)可保护多酚免受氧化降解,提高产量至 1.71 g/L RES。

聚酮类化合物如 noreugenin、6 - 甲基水杨酸(6MSA)、杀菌素 C 等也可通过异源表达 PKSs 在谷氨酸棒状杆菌中合成。例如,表达 pentaketide chromone synthase(PCS)合成 noreugenin,表达 6MSA synthase(ChlB1)合成 6MSA,利用适应性实验室进化(ALE)优化杀菌素 C 生产。

其他芳香族化合物


3 - 氨基 - 4 - 羟基苯甲酸(3,4-AHBA)作为生物塑料前体,通过异源表达 griI、griH 基因,利用甜高粱汁为底物生产,优化后菌株在葡萄糖补料分批培养中积累 5.6 g/L。

结论与挑战


谷氨酸棒状杆菌已成为芳香族化合物生产的多功能平台,但仍需提高成本竞争力。当前依赖营养缺陷型菌株,需复杂培养基,未来应开发无缺陷型菌株、利用定义培养基。生物铸造厂及高通量技术可加速菌株优化,膜损伤缓解策略(如添加游离脂肪酸)可提升产物耐受性。未来研究将聚焦代谢工程、过程优化及新型合成途径开发,推动微生物合成芳香族化合物的工业化应用。

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