基于 Python 的全玻片图像从 DICOM 到类 ScanScope 虚拟玻片 TIFF 格式转换：教学、研究及协同诊断的实用解决方案

《Virchows Archiv》：Converting whole slide images from DICOM to ScanScope Virtual Slide-like TIFF: a practical workaround for teaching, research, and collaborative diagnosis

病理科数字化转型中鼓励采用 DICOM 格式，但部分平台不支持该格式，限制其在协同诊断、教学和研究中的应用。研究人员提出开源 Python 方案，将多厂商 DICOM 全玻片图像（WSI）转为类 SVS 的 TIFF 格式，转换无损且高效，已在机构成功应用。

　　

在病理科数字化转型进程中，业界提倡将医学数字成像和通信（DICOM）格式用于常规诊断。然而 DICOM 的普及仍处于发展阶段，不少观察平台尚不支持该格式，这对其在协同诊断、教学和研究领域的应用形成了限制。本文提出一种基于 Python 的开源解决方案，并附详细说明，可将从不同厂商获取的 DICOM 全玻片图像（WSI）文件转换为类似 ScanScope 虚拟玻片（SVS）的文件，与徕卡生物系统等使用的格式相匹配。该转换过程为无损转换，能保留原始图像质量，支持单平面明场和单 plex 荧光图像。文中不仅给出了原生 Python 脚本，还提供了兼容 Windows 和 macOS 系统的可执行文件，便于无编程经验者日常使用。此方案对来自徕卡、3DHistech、罗氏、滨松和奥林巴斯 / Evident 这五大厂商的 70 张 DICOM 玻片进行了测试。在机构工作站上，约 1GB 文件的玻片转换平均耗时约 18 秒，而使用更高效率的工作站则可缩短至约 3 秒。转换后的 WSI 能在三款兼容 SVS 的软件程序中成功打开。该解决方案已在作者所在机构成功实施，切实解决了病理学家和研究人员在共享和使用数字化玻片时面临的实际问题。