澳大利亚温泉宏基因组中发现的热稳定自给型细胞色素P450 CYP116B305的表征及其生物催化应用

【字体: 时间:2025年06月02日 来源:Applied Microbiology and Biotechnology 3.9

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  本研究针对工业应用中细胞色素P450(CYPs)稳定性差、依赖氧化还原伴侣等瓶颈问题,通过宏基因组挖掘从澳大利亚Innot温泉(71°C)中发现新型热稳定自给型P450酶CYP116B305。该酶在45°C下催化2-羟基苯乙酸(2-HPA)C-5位羟基化的效率显著提升(耦合效率达82%),其血红素域和还原酶域15T50值分别为56.9°C和52.5°C,为高温生物催化提供了新工具。

  

在生物催化领域,细胞色素P450(CYPs)因其卓越的C-H键氧化能力备受关注,但其工业应用长期受限于热稳定性差、表达效率低以及对氧化还原伴侣的依赖性。传统P450在高温工业环境中易失活,而自给型P450(如CYP102和CYP116家族)虽能通过融合氧化还原域解决伴侣依赖问题,但热稳定性仍是瓶颈。更棘手的是,极端环境微生物难以培养,限制了新型热稳定酶的发现。

为解决这些问题,澳大利亚昆士兰大学等机构的研究团队另辟蹊径,从北昆士兰Innot温泉(71°C)的宏基因组数据中挖掘出新型自给型P450——CYP116B305。该酶源自未培养的Geminicoccaceae家族微生物,其血红素域与还原酶域天然融合,兼具热稳定性和高效电子传递特性。研究发现,CYP116B305在45°C下对2-HPA的羟基化活性较25°C提升6.5倍,耦合效率高达82%,其血红素域15T50达56.9°C,远超常见中温P450(如CYP108A1仅40.1°C)。这项突破性成果发表于《Applied Microbiology and Biotechnology》,为高温生物制造提供了新一代平台酶。

研究团队采用多项关键技术:宏基因组组装与基因挖掘锁定目标序列;大肠杆菌异源表达优化(通过5-氨基乙酰丙酸和核黄素补充提升辅因子装载);差示光谱法测定热稳定性参数(T50);紫外-可见光谱分析辅因子结合状态;气相色谱-质谱(GC-MS)鉴定代谢产物;光谱电化学解析氧化还原电位。

关键结果

  1. 热稳定性表征:CYP116B305血红素域15T50达56.9±0.1°C,还原酶域为52.5±0.5°C,在45°C下仍保持95%活性,显著优于中温P450。
  2. 底物特异性:对2-HPA和HPPA结合亲和力极强(KD=0.4μM),羟基化位点专一(C-5位),生成高附加值产物高龙胆酸。
  3. 温度依赖性催化:45°C时NADPH氧化速率达85 min-1,较25°C提升6.5倍,耦合效率提高37%。
  4. 结构基础:AlphaFold预测显示活性中心保留CYP116家族典型四层残基架构,但存在Ser310/Ile311等独特替换,可能影响热适应性。

结论与意义
该研究首次报道了来自Geminicoccales目微生物的自给型P450,其创新性体现在:

  1. 方法论:通过非培养的宏基因组策略突破极端环境微生物酶资源开发瓶颈;
  2. 应用价值:高温下增强的催化效率(如2-HPA转化率100%)和稳定性可降低工业过程冷却成本;
  3. 机制启示:发现还原酶域可跨分子传递电子,为构建嵌合P450系统提供新思路。

未来研究可聚焦于:优化FMN辅因子装载率(当前仅33%)、解析晶体结构指导理性设计,以及拓展其在芳香族化合物绿色合成中的应用。这项研究为开发"耐高温生物催化剂工具箱"树立了新标杆,对可持续化学生产具有重要推动作用。

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