航空污水监测揭示SARS-CoV-2传播链:从入境航班到城市尺度的病毒变异追踪

【字体: 时间:2025年06月03日 来源:Nature Communications 14.7

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  为解决国际旅行中SARS-CoV-2变异株早期监测难题,瑞典公共卫生团队开展了一项创新性研究,通过航空污水、机场及城市污水处理厂(WWTPs)的多尺度采样,结合RT-qPCR和下一代测序(NGS)技术,系统分析了969种病毒变异株的传播动态。研究发现,污水监测可提前5周检出临床未报告的变异株,且变异多样性是临床数据的6倍,为全球公共卫生监测提供了高效、低成本的新策略。

  

随着COVID-19大流行持续,病毒变异株通过国际旅行快速传播成为全球防控的痛点。尽管各国曾实施旅客核酸检测和旅行限制,但成本高、覆盖率低,且无法捕捉无症状感染者。更棘手的是,临床监测往往滞后1-2周,而奥密克戎(Omicron)亚型的频繁出现(如XBB谱系)加剧了防控难度。在此背景下,瑞典公共卫生局(PHAS)联合多机构开展了一项开创性研究,首次将航空污水、机场污水与城市污水处理系统(WWTPs)的监测数据联动,揭示了病毒从入境点到社区的传播链条。这项发表在《Nature Communications》的成果,为全球疫情预警提供了新范式。

研究团队采用三大关键技术:1)多尺度采样(航班真空厕所、机场污水管网及斯德哥尔摩3座WWTPs的6个进水口);2)基于SYBRGreen的RT-qPCR定量(N3引物靶向核衣壳蛋白基因,以PMMoV病毒标准化数据);3)下一代测序(NGS)结合Freyja算法解析变异谱(覆盖969个变异株)。通过统计学分析(Pearson相关性、Procrustes变换)比较不同采样点的病毒载量与变异组成。

研究结果

病毒载量的空间异质性
通过PMMoV标准化发现,单个WWTP(如服务33%人口的Kappala)的病毒载量无法代表全市(r=0.37,P=0.095),需联合Henriksdal(覆盖41%人口)等厂数据。航空污水因粪便稀释度高,检测限波动大(PMMoV方差达3.3×1015基因拷贝/L),但第8、16周仍检出峰值,与机场污水第17周高峰吻合(r=0.60)。

变异监测的时空优势
NGS显示,污水变异谱比临床数据丰富6倍(图4)。XBB.1.5等变异株在污水中比临床早4周检出。值得注意的是,中国航班检出的变异株(如BQ.1)未在本地扩散,而临床数据中BA.5的检出滞后污水5周,凸显污水监测的预警价值。

多尺度变异传播网络
通过UpsetPlot分析(图4b),34个变异株同时存在于所有采样点,21个仅未出现在航班。10个变异株(如部分XBB谱系)在航班/机场检出却未进入城市污水,提示入境筛查的潜在作用。

结论与意义
该研究证实,航空污水监测相当于随机检测20%旅客的效果,且成本更低。通过建立“航班-机场-城市”三级监测网,可提前识别输入性变异株(如中国航班携带的XBB),并量化其社区传播风险。污水流行病学(WBE)的早期预警能力(如检出无症状感染)、高性价比(覆盖百万人口仅需WWTP采样)及多病原体同步监测潜力,使其成为后疫情时代全球健康安全的核心工具。正如作者Mariel Perez-Zabaleta等强调,这项研究为交通枢纽监测标准化提供了科学模板,未来可扩展至港口、高铁等场景。

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