快速宏基因组测序(RaMSes)技术在血液恶性肿瘤合并肺部并发症患者感染诊断中的应用价值

本研究针对血液恶性肿瘤(HM)患者肺部并发症(PCs)诊断难题，通过前瞻性队列研究比较了传统微生物检测(CMT)与16S/Nanopore测序技术的效能。结果显示测序技术可额外检出59.3%的潜在病原体，但真菌检出率低，为精准诊疗提供了新思路。

　　

在血液恶性肿瘤(HM)患者的临床管理中，肺部并发症(PCs)始终是棘手的难题。这些患者因免疫抑制状态，常面临感染性与非感染性肺部病变的鉴别困境。传统微生物检测(CMT)方法不仅耗时长，其灵敏度也仅53%，导致临床不得不长期依赖经验性抗生素和糖皮质激素治疗——这种"双刃剑"式疗法可能加剧真菌感染风险或掩盖真实病因。

为破解这一临床困局，研究人员开展了一项前瞻性概念验证研究，论文发表在《CHEST Pulmonary》。该研究创新性地将快速宏基因组测序(Rapid Metagenomic Sequencing, RaMSes)技术应用于30例HM合并PCs患者的支气管肺泡灌洗液(BALF)检测，通过平行比较16S rRNA基因测序、纳米孔测序(Nanopore)与CMT的结果，系统评估了分子诊断技术的临床应用价值。

关键技术包括：1) 前瞻性收集HM住院患者的BALF样本建立研究队列；2) 并行开展CMT(含培养和PCR检测)与两种测序技术；3) 采用生物信息学分析微生物群落组成；4) 通过阳性/阴性符合率评估检测一致性。

研究结果部分显示：
<背景> 证实了临床诊断困境，CMT阳性率仅53%，凸显现有方法的局限性。
<研究问题> 首次系统比较了测序技术与CMT在HM患者中的病原体检出差异。
<研究设计和方法> 创新性地采用双测序平台交叉验证，16S测序阳性符合率达66.7%，显著高于Nanopore的6.7%。
<结果> 测序技术额外检出59.3%潜在病原体，但真菌检出仍是技术短板。
<解释> 提出"临床漏诊"与"定植菌"的鉴别需要更大样本验证。

结论部分强调，该研究为HM患者PCs诊断提供了重要循证依据：1) 证实测序技术可突破CMT的检测瓶颈，尤其对细菌性PCs诊断价值显著；2) 揭示不同测序平台特性差异，16S在细菌检测中优势明显，而Nanopore在阴性排除方面特异性达87.5%；3) 提出"微生物群-宿主"互作研究新方向，为个体化抗感染治疗奠定基础。值得注意的是，研究者特别指出，对测序检出的额外微生物需谨慎解读，可能涉及临床未识别感染(subclinical infection)或免疫抑制相关的微生物定植(colonization)，这为后续研究指明了重要方向。