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β-乳球蛋白-4-甲基邻苯二酚加合物的结构动态变化:分子动力学与元动力学模拟揭示的构象稳定性机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月03日 来源:Food Hydrocolloids 11.0
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推荐:本研究通过分子动力学(MD)和元动力学(MTD)模拟,解析了4-甲基邻苯二酚(4MC)修饰对β-乳球蛋白(β-LG)构象稳定性的影响。发现4MC修饰增加蛋白柔性但保留三级结构,α-螺旋更易解折叠,且β-LQ19模型中57-70残基区域展开,解释了实验观测的热稳定性降低现象,为食品蛋白质-多酚加合物的功能设计提供理论依据。
在食品加工和储存过程中,蛋白质与多酚的共价结合会显著改变其功能特性,但分子层面的结构变化机制尚不明确。β-乳球蛋白(β-LG)作为乳清蛋白的主要成分,其与4-甲基邻苯二酚(4MC)的迈克尔加成产物(β-LQ)在热稳定性、乳化性等方面表现出独特性质,然而这些功能变化的构象基础仍是未解之谜。传统实验技术如X射线晶体学和核磁共振(NMR)虽能提供静态结构信息,却难以捕捉动态构象变化,而计算模拟为此提供了新视角。
来自丹麦哥本哈根大学的研究团队在《Food Hydrocolloids》发表研究,通过分子动力学(MD)和元动力学(MTD)模拟结合实验验证,系统揭示了β-LG-4MC加合物的构象变化规律。研究采用400 ns恒定pH MD模拟和500 ns MTD模拟,构建了含4个(β-LQ4)和19个(β-LQ19)4MC修饰位点的模型,以未修饰β-LG为对照,通过RMSD(均方根偏差)、RMSF(均方根涨落)、溶剂可及表面积(SASA)等参数分析结构变化,并利用差示扫描量热法(DSC)验证热稳定性。
3.1.1 二级结构变化
DSSP算法分析显示,β-LG含39% β-折叠和12% α-螺旋。4MC修饰仅在高修饰量β-LQ19中引起α-螺旋显著减少(8±2%),β-折叠结构始终保持稳定,说明4MC优先破坏α-螺旋的稳定性。
3.1.2 三级结构变化
RMSF分析揭示4MC修饰剂量依赖性增加蛋白柔性(β-LQ19>>β-LQ4>>β-LG),但三级结构整体保持完整。特别发现Trp19-4MC的SASA值从7.0±0.3 ?(β-LG)增至29±4 ?(β-LQ19),其周围亲疏水相互作用网络重构,提示该位点可能通过π-π堆积与邻近4MC修饰残基(如Arg124-4MC)产生非共价相互作用。
3.2.2 自由能面与去折叠
MTD模拟以RMSD为变量时,β-LQ19在残基57-70区域(含Cys66-4MC和Lys70-4MC)出现β-折叠解离,该区域恰为β-LG已知的热敏感区。而β-LQ4反而出现较天然β-LG更稳定的折叠构象(D态),表明适度4MC修饰可能增强结构稳定性。
3.3.1 热变性实验验证
DSC测定显示β-LQ变性温度(62.0±0.6°C)显著低于β-LG(67.0±0.2°C),与MTD预测的β-LQ19局部解折叠现象高度吻合,但变性焓变(ΔH)无显著差异,说明4MC修饰降低热稳定性但不影响整体折叠能垒。
该研究首次将增强采样模拟应用于蛋白质-多酚加合物体系,阐明α-螺旋易损性和局部β-折叠解离是热稳定性降低的结构基础。发现Trp19微环境变化为解释多酚修饰导致的荧光猝灭提供了结构依据,而修饰位点数量与构象变化的剂量效应关系为精准设计食品蛋白质功能特性提供了新思路。研究建立的模拟策略可拓展应用于其他共价修饰蛋白体系,对理解食品加工中蛋白质结构-功能关系具有重要方法论意义。
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