ZG16B错义突变的结构与功能影响：计算预测揭示其在肿瘤进展中的分子机制

为解决ZG16B基因变异在肿瘤中功能不清的问题，研究人员通过计算生物学方法系统分析了28个nsSNPs，筛选出W97R、E117K等4个高致病性突变，结合SWISS-MODEL建模、分子动力学模拟(500ns)及蛋白互作分析，发现突变导致氢键破坏、疏水核心改变及与溶菌酶(LYZ)结合能力下降，为癌症诊断和靶向治疗提供新视角。

　　

人类zymogen颗粒蛋白16同源物B（ZG16B）作为一种分泌型凝集素，通过调控自分泌和旁分泌信号通路在肿瘤转移中扮演关键角色。尽管其在胰腺癌、结直肠癌等多种恶性肿瘤中高表达，但基因变异对其功能的影响仍属未知领域。

这项研究构建了涵盖28个非同义单核苷酸多态性（nsSNPs）的分析框架，利用SIFT、PolyPhen-2等算法锁定W97R、E117K、Y142N和P186L四个高危突变位点。通过SWISS-MODEL同源建模结合HOPE、Missense3D等工具，发现突变导致蛋白质三维结构出现氢键网络断裂、疏水核心重构等缺陷。DUET和iStable稳定性预测证实这些变异显著降低蛋白折叠稳定性。

500纳秒分子动力学（MD）模拟显示，突变体均方根偏差（RMSD）波动幅度增大，关键功能区的均方根涨落（RMSF）图谱发生明显偏移。更有趣的是，STRING数据库分析和分子对接实验表明，突变体与溶菌酶（LYZ）的结合自由能升高，相互作用界面氢键数量减少40%，疏水作用面积缩小25%。这些发现揭示了肿瘤中ZG16B过表达伴随功能缺失突变的矛盾现象——就像"高速行驶却刹车失灵的汽车"，结构缺陷可能导致其促癌信号传导失控。

这项研究为ZG16B变异致癌机制提供了原子层面的解释，其建立的nsSNPs计算评估流程可推广至其他癌症相关基因研究。