GC富集DNA基质荧光标记策略优化：基于氰染料修饰核苷酸衍生物的微阵列杂交分析

为解决GC富集DNA（如TERT基因启动子区）荧光标记效率低的问题，研究人员通过对比氰染料Cy5/Cy7修饰的dU/dC衍生物在PCR中的掺入效果及微阵列杂交信号强度，发现dU-Cy7标记通用性最强，dC-Cy5在GC富集模板中表现突出，为生物芯片诊断系统开发提供了新型标记策略。

　　

研究团队探索了GC富集DNA基质的高效荧光标记方案，重点针对人类基因组中端粒酶逆转录酶（TERT）基因启动子区。实验采用经花菁染料Cy5或Cy7修饰的2′-脱氧尿苷（dU）和2′-脱氧胞苷（dC）三磷酸衍生物，通过实时定量PCR评估这些修饰核苷酸对扩增效率的影响，并测定其在PCR产物中的掺入率。

有趣的是，在生物微阵列（biochip）的等位基因特异性杂交实验中，dU-Cy7衍生物展现出最强的凝胶点荧光信号，显著优于dU-Cy5和dC-Cy5。但针对GC含量高的DNA模板时，dC-Cy5却表现出独特优势——其标记效果远超dU-Cy5。这表明Cy7修饰的核苷酸衍生物对DNA模板的GC组成依赖性更低，堪称诊断领域更普适的荧光标记物。

该发现为"芯片实验室"（lab-on-a-chip）检测系统的开发指明方向：基于Cy7修饰的核苷酸类似物，有望成为下一代分子诊断技术的明星标记策略。