基于生物信息学分析筛选和鉴定人类胶质母细胞瘤关键生物标志物及药物靶点

【字体: 时间:2025年06月04日 来源:Current Medicinal Chemistry 3.5

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  胶质母细胞瘤预后差且分子机制复杂。研究人员分析 GEO 数据库中 GSE13276 等微阵列数据集,鉴定差异表达基因(DEGs)并构建蛋白互作网络(PPI)。发现 88 个 DEGs 及 27 个关键基因,部分基因与肿瘤发展等相关,为诊疗提供新方向。

  
胶质母细胞瘤是最常见的脑癌类型,其预后较差。尽管该领域已有显著进展,但其复杂的分子机制仍不明确。本研究旨在鉴定胶质母细胞瘤的遗传标志物并揭示其发展背后的过程。

超级计算技术的出现与整合推动了基因表达分析平台的显著进步。微阵列分析在肿瘤学中具有关键作用,对肿瘤的分子分类、诊断、预后、患者分层、预测肿瘤反应及确定药物发现新靶点至关重要。包括基因表达综合数据库(GEO 数据库)在内的众多癌症研究数据库已建立。鉴定差异表达基因(DEGs)和关键基因可加深我们对胶质母细胞瘤起始的理解,有望揭示诊断和预后新标志物以及胶质母细胞瘤治疗靶点。

本研究通过分析 GEO 数据库中的微阵列数据集 GSE13276、GSE14805 和 GSE109857,旨在发现与胶质母细胞瘤发生和进展相关的基因。研究鉴定了 DEGs 并进行了功能富集分析,此外还构建了蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI)网络,并使用 STRING 和 Cytoscape 工具进行模块分析。

分析得出 88 个 DEGs,包括 66 个上调基因和 22 个下调基因。这些基因的功能和通路主要涉及微管活动、有丝分裂胞质分裂、大脑皮层发育、蛋白质在动粒的定位以及有丝分裂期间染色体的浓缩。研究确定了一组 27 个关键基因,生物过程分析表明其在有丝分裂期间细胞核分裂、细胞分裂、维持姐妹染色单体 cohesion、有丝分裂期间姐妹染色单体分离和胞质分裂等活动中显著富集。生存分析表明,某些基因,包括 PCNA 钳相关因子(PCLAF)、核糖核苷二磷酸还原酶亚基 M2(RRM2)、核仁与纺锤体相关蛋白 1(NUSAP1)和驱动蛋白家族成员 23(KIF23),可能在胶质母细胞瘤的发展、侵袭或复发中起作用。

本研究中 DEGs 和关键基因的鉴定增进了我们对促成胶质母细胞瘤发生和进展的分子通路的理解,为胶质母细胞瘤潜在的诊断和治疗靶点提供了有价值的见解。
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