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微藻高通量表型自动化分析系统PhenoSelect的开发与应用:推动可持续生物技术的规模化解决方案
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月04日 来源:Bioresource Technology 9.7
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针对微藻表型分析平台缺乏整合性与规模化的问题,研究人员开发了自动化系统PhenoSelect,结合机器人技术、光谱学、流式细胞术等多模态技术,实现了96种环境条件下5种藻类的光合效率(Fv/Fm)、生长速率(μ day-1)和细胞尺寸的多维度量化。通过凸包体积(convex hull volume)量化表型可塑性,发现雨生红球藻(Haematococcus pluvialis)具有最大表型组规模,为生物燃料和营养保健品开发提供了高效筛选工具。
微藻作为"光合细胞工厂"在生物燃料、碳捕获和高价值化合物合成等领域展现出巨大潜力,但传统表型分析方法面临三大瓶颈:一是现有平台难以整合光合参数(Fv/Fm)、生长动力学和形态学等多维数据;二是手工操作无法满足工业级菌株筛选的通量需求;三是环境条件与表型响应间的定量关系不明确。这些问题严重制约了从实验室研究到规模化应用的转化效率。
针对这些挑战,澳大利亚国家藻类保藏中心(CSIRO)联合捷克PSI公司的研究人员在《Bioresource Technology》发表了创新性解决方案。团队开发了PhenoSelect系统——一个占地19m2的自动化表型分析平台,整合机器人臂轨道系统、双温控培养舱(20/25°C)、可调光强LED(10-80 μmol photons m-2 s-1)以及4种核心检测模块:高光谱相机(VNIR)、脉冲调制荧光仪(Flat FluorCam FC 1300/2020)、流式细胞仪(CytoFLEX LX)和全自动酶标仪(Tecan Spark)。
关键技术方法包括:1) 使用96孔板建立梯度环境条件矩阵(温度×光强×12种培养基);2) 机器人自动完成开盖、转移和连续5天数据采集;3) 流式细胞术结合标准微球(F13838)校准细胞尺寸;4) Python实现三维表型空间凸包体积计算和Bootstrap统计学分析。
研究结果:
系统验证:
平台每日可完成8个藻株的完整表型分析,误差条显示标准偏差极小(归因于环境控制精度±0.5°C和自动化采样)。以蛋白核小球藻(Chlorella sorokiniana CS-903)为例,其最大光合效率出现在25°C/10μE/MLA+0.4mM MgSO4条件,而最佳生长速率(0.501 day-1)见于25°C/20μE/100% MLA培养基,证实光强与营养的协同调控效应。
物种特异性响应:
五类藻种表现出显著差异的适应策略。雨生红球藻(H. pluvialis CS-1031)在80μE高光下获得最大生长速率(0.913 day-1),而三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum CS-786)则在10μE低光/F/2+0.8mM NaNO3条件下最优。耐盐藻株Halospirulina tapeticola在200mM NaCl2胁迫下细胞体积缩小28%,揭示形态可塑性是盐度适应的关键机制。
表型组规模量化:
通过三维凸包模型(光合效率-生长速率-细胞尺寸)首次量化物种可塑性差异。原始数据显示H. pluvialis表型空间最大(2.0117±0.2535),而微拟球藻(Nannochloropsis australis CS-416)最小(0.1529±0.0262)。但经标准化处理后各物种相对可塑性无统计学差异,表明绝对表型范围不能直接等同于适应潜力。
讨论与意义:
这项研究突破了传统表型分析的三大局限:1) 通过机器人集成实现每日数百个条件的高通量筛选;2) 开发Ranked Spider Plots可视化工具直观展示96种条件的表型排序;3) 建立凸包体积作为量化藻类表型可塑性的新指标。特别值得注意的是,系统发现的低光(10-20μE)促进光合效率、中光(20-40μE)优化生长的规律,为光生物反应器设计提供了精确参数。
尽管微孔板培养与工业规模的生理响应仍存在差异,但PhenoSelect系统显著加速了从菌株筛选到中试放大的进程。未来通过整合拉曼光谱和离心模块,可进一步拓展至代谢物动态监测领域。该技术对实现"设计-构建-测试-学习"(DBTL)循环在藻类合成生物学中的应用具有里程碑意义,为碳中和目标下的可持续生物制造提供了强大工具。
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