中国广西地区猪源Enterocytozoon bieneusi首次分子检测及多基因位点分型研究

本研究针对广西壮族自治区猪群中机会性病原体Enterocytozoon bieneusi（微孢子虫）的流行情况及人畜共患风险展开系统调查。研究人员通过巢式PCR和多基因位点序列分型（MLST）技术，在721份猪粪便样本中发现总体感染率达24.55%，鉴定出12个已知基因型和10个新基因型（GXP-1至GXP-10），其中EbpC和EbpA为优势基因型。所有基因型均属于人畜共患风险组1，44种独特多位点基因型（MLGs）的发现揭示了该病原体复杂的种群结构，为制定防控策略提供了重要科学依据。

　　

微孢子虫病是由专性细胞内寄生的Enterocytozoon bieneusi（E. bieneusi）引起的全球性人畜共患病，该病原体可感染包括人类、家畜和野生动物在内的广泛宿主。作为免疫缺陷患者腹泻的主要病原体，E. bieneusi在猪群中的感染率高达60%，远高于其他动物和人类。其微小孢子（1.1-1.6 μm）通过污染水源或气溶胶传播的特性，使得传统显微镜检测方法面临巨大挑战。尽管中国多个省份已报道猪群感染情况，但作为中国重要养猪基地的广西壮族自治区，其流行病学特征和基因型分布仍属空白。

福建农林大学动物科学学院的研究团队联合广西农业职业技术学院，首次对广西四个地区（贵港、南宁、贺州和玉林）的721头猪开展系统性研究。通过巢式PCR扩增核糖体RNA内转录间隔区（ITS）基因，结合微卫星（MS1、MS3、MS7）和微随体（MS4）位点的多基因位点分型技术，揭示了该地区E. bieneusi的流行规律和遗传多样性。研究成果发表在《BMC Veterinary Research》，为评估人畜共患风险提供了关键数据。

研究采用巢式PCR技术检测ITS基因，阳性样本进一步通过MLST分析四个基因位点。统计方法采用卡方检验分析地区、猪群类型和饲养模式间的感染率差异，通过二元逻辑回归计算比值比（OR）。系统发育分析使用MEGA 11软件基于Kimura 2参数模型构建最大似然树。

地区差异与风险因素
南宁地区感染率最高（43.26%），显著高于贺州（11.48%）和玉林（14.38%）。保育猪感染风险是育肥猪的4.045倍（OR=4.045），散养模式感染率（34.71%）是集约化养殖（16.71%）的2.897倍。这些差异与养殖密度、免疫状态和管理水平密切相关。

基因型多样性
发现的22个基因型包括12个已知型（如EbpC、EbpA）和10个新发现的GXP系列。EbpC（27.68%）和EbpA（20.34%）为优势基因型，新基因型GXP-2（6.21%）呈现最高流行率。单核苷酸多态性（SNP）分析显示，新基因型多在ITS基因的171、212等位点发生G→T或A→G等突变。

系统发育与传播风险
所有基因型均聚类于人畜共患风险组1，与曾在人类病例中发现的EbpC、EbpA等基因型亲缘关系密切。首次在猪中检测到犬源基因型O、牛蛙源BLC17和藏绵羊源CTS3，证实了跨物种传播潜力。

多位点分型特征
57个样本成功扩增四个位点，形成44种MLGs。EbpC和EbpA分别产生13和11种MLGs，显示高度遗传多样性。相同ITS基因型在不同养殖系统中呈现不同MLGs分布，揭示环境压力可能驱动病原体进化。

该研究首次绘制了广西猪群E. bieneusi的分子流行病学图谱，证实流行基因型均具有人畜共患潜力。保育猪和散养模式的高感染风险提示需加强早期防控，44种MLGs的发现为追踪传播链提供了精细标记。研究建立的监测体系可推广至其他畜牧业地区，对保障食品安全和公共卫生安全具有重要实践意义。从进化角度看，新基因型的持续出现反映了病原体对养殖环境的适应性进化，需警惕其可能带来的诊断和治疗挑战。