印度阿南德地区乳制品源大肠杆菌SKN 649和葡萄球菌SKN 217的多重耐药性与毒力因子的比较基因组学研究

【编辑推荐】本研究针对印度阿南德地区乳制品中分离的XDR（广泛耐药）大肠杆菌SKN 649和葡萄球菌SKN 217，通过全基因组测序（WGS）解析其AMR（抗菌素耐药性）基因谱与毒力因子，揭示efflux pump（外排泵）和靶点修饰等关键机制，为遏制耐药菌经食物链传播提供科学依据，对"One Health"（全健康）框架下的耐药性防控具有重要启示。

　　

乳制品作为人类营养的重要来源，其安全性直接关系到公共健康。然而，随着抗生素在畜牧业的滥用，乳制品中耐药病原体的出现已成为全球性威胁。印度作为抗生素消费大国和乳业生产重地，其乳制品中耐药菌的流行状况尤为令人担忧。研究显示，耐药菌可通过食物链传播给人类，导致临床治疗失败。其中，大肠杆菌和葡萄球菌作为乳制品常见污染菌，其多重耐药株（MDR）甚至广泛耐药株（XDR）的出现，使得传统抗生素治疗陷入困境。

为揭示这一问题，中国研究人员对印度古吉拉特邦阿南德地区采集的100份生乳和酪乳样本展开研究，通过全基因组测序技术（WGS）对比分析了两株代表性XDR菌株——大肠杆菌SKN 649和葡萄球菌SKN 217的耐药基因谱与毒力特征。研究发现，这两株菌对β-内酰胺类、氨基糖苷类等常用抗生素表现出广泛耐药性，仅对四环素等少数药物敏感。基因组分析揭示了包括外排泵基因emrB、靶点修饰基因vanG等在内的复杂耐药机制。该成果发表于《International Dairy Journal》，为制定乳业抗生素使用规范提供了分子层面的科学依据。

研究采用的主要技术包括：MALDI-TOF质谱进行菌种鉴定；CLSI标准方法检测抗生素敏感性；Illumina平台全基因组测序；通过CARD数据库注释耐药基因；采用MLST和SNP分析进行分子分型。样本来源于2022-2023年间阿南德地区60份生乳和40份酪乳。

【采样】研究团队系统采集了阿南德地区地理坐标22.5645° N, 72.9289° E范围内的乳制品样本，确保样本代表性与微生物完整性。

【分离鉴定】通过选择性培养和质谱技术，鉴定出优势XDR菌株大肠杆菌SKN 649和葡萄球菌SKN 217，其耐药表型覆盖青霉素、头孢菌素等多类抗生素。

【表型特征】药敏试验显示，90%的葡萄球菌分离株对多种抗生素耐药，而大肠杆菌对四环素类保持敏感，这种差异提示耐药机制可能存在种属特异性。

【结论】该研究首次系统揭示了印度乳制品源XDR菌株的基因组特征：大肠杆菌SKN 649携带kdpE、rsmA等耐药基因，葡萄球菌SKN 217则富含norC、sdrM等外排泵基因。这些发现证实了兽医抗生素滥用与耐药基因传播的直接关联，强调了乳制品作为耐药基因库的潜在风险。

【讨论】从"全健康"视角看，研究凸显了三大意义：一是建立了乳制品耐药菌基因组监测方法；二是为追溯耐药基因农业起源提供分子标记；三警示需加强乳业抗生素监管。特别是发现葡萄球菌携带的vanT基因与临床万古霉素耐药相关，提示动物源耐药菌可能威胁人类最后防线抗生素的疗效。未来研究应聚焦耐药菌跨物种传播机制及新型防控策略开发。