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岛屿蜥蜴加那利石龙子肠道微生物组的性别、环境与种群遗传分化关联性研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月06日 来源:Microbial Ecology 3.3
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这篇研究通过宏条形码技术分析了加那利群岛特有蜥蜴Gallotia galloti的肠道微生物组,探讨了性别、环境(年均温、降水)、人类活动足迹及亚种身份对其多样性和组成的影响。结果表明,尽管该物种存在显著的生态和遗传分化,但其肠道菌群在门、科、属水平均未表现出与上述因素的显著关联,推测其广食性特征可能抵消了环境差异的影响,为理解野生爬行动物微生物组的稳定性提供了新视角。
Gallotia galloti作为加那利群岛特有的蜥蜴物种,其表型和遗传分化显著,但肠道微生物组是否反映这种多样性尚不明确。研究对47只个体的粪便样本进行16S rRNA基因测序(V3-V4区),覆盖13个不同环境条件的采样点。结果显示,无论从门(如厚壁菌门Firmicutes和拟杆菌门Bacteroidota占比超88%)、科(毛螺菌科Lachnospiraceae等主导)还是属水平(拟杆菌属Bacteroides占21%),微生物组的丰富度和组成均未与性别、年均温、降水量或人类足迹显著相关。这一发现暗示其广食性策略可能通过摄入多样化食物维持了菌群的跨岛屿稳定性。
肠道微生物在营养吸收、解毒和免疫调节中起关键作用,但野生爬行动物的相关研究较少。G. galloti作为研究模型具有独特优势:其四个亚种分布于从海岸到海拔3715米的多样化生境,呈现明显的表型分化(如北部与南部形态差异)。研究假设环境梯度或遗传分化会驱动微生物组变异,但需验证其是否被广食性缓冲。
样本采集于2023年4-5月,采用非侵入性方法获取粪便,使用PowerFecal Pro试剂盒提取DNA,Illumina NovaSeq平台测序。环境数据来自WorldClim 2.1和人类足迹数据集。分析采用PERMANOVA(基于Bray-Curtis距离)和线性混合模型,以采样点为随机效应。
共获得2,198,765条高质量序列,平均每样本46,782±10,511条。优势菌群为Firmicutes(64.1%)、Bacteroidota(24.3%)和变形菌门Proteobacteria(4.9%)。NMDS分析显示微生物组组成无显著聚类(图3),PERMANOVA表明所有测试变量(p>0.05)及envfit拟合的环境因子(R2
<0.10)均无显著影响。
与多数蜥蜴研究一致,G. galloti的菌群以Firmicutes和Bacteroidota为主,但不同于其他物种(如Sceloporus occidentalis)表现出的温度敏感性。这种稳定性可能源于:1)广食性导致的饮食同质化;2)核心菌群(如Bacteroides)的功能冗余。值得注意的是,人类活动未显著改变菌群,可能与岛屿生态系统的低干扰强度有关。
研究揭示了G. galloti肠道微生物组对环境及遗传分化的强韧性,为岛屿物种的微生物生态适应机制提供了新见解。未来需扩大季节和空间采样以探索稀有菌群的作用,并结合代谢组学解析功能层面的适应策略。
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