基于弱监督深度学习的全切片图像空间解析方法WEEP在乳腺癌病理分级中的应用研究

【字体: 时间:2025年06月06日 来源:Scientific Reports 3.8

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  针对弱监督学习模型在计算病理学中空间解释性不足的问题,研究人员开发了Wsi rEgion sElection aPproach(WEEP)方法,通过逆向选择策略定位驱动全切片图像(WSI)分类的关键区域。该研究在乳腺癌组织学分级(NHG 1 vs. 3)任务中验证了WEEP的有效性,结合ResNet-18、UNI等特征提取器和TransMIL等聚合模型,揭示了模型决策依赖的形态学区域,为病理AI的可解释性提供了新工具。

  

在数字病理学领域,全切片图像(Whole Slide Image, WSI)的庞大数据量使得传统分析方法面临巨大挑战。尽管深度学习技术已成功应用于WSI的自动分类和预后预测,但大多数模型采用弱监督学习(Weakly Supervised Learning)策略——即仅使用患者或WSI级别的标签(如组织学分级或生存结局)进行训练。这种模式下,模型如何从数以万计的图像块(tile)中识别关键诊断区域,成为临床可信度提升的瓶颈。现有解释方法如类激活图(Class Activation Maps, CAM)虽能展示单个tile内的显著区域,却无法回答“哪些tile的组合最终触发了整个切片的阳性分类”这一核心问题。

针对这一挑战,瑞典卡罗林斯卡医学院的Mattias Rantalainen团队在《Scientific Reports》发表了创新性研究。他们提出的WEEP方法(Wsi rEgion sElection aPproach)通过逆向选择策略,首次建立了弱监督模型决策与空间区域的直接关联。研究以乳腺癌组织学分级(Nottingham Histologic Grade, NHG)1级与3级的二分类为范例,揭示了不同特征提取器和聚合函数下模型依赖的关键形态学区域。

研究团队采用多中心队列SoS-BC-4的1,695例H&E染色WSI,通过5折交叉验证评估了四种建模策略:基于ResNet-18的75百分位聚合、注意力MIL(atten-MIL)、UNI预训练模型+TransMIL聚合以及UNI+atten-MIL组合。WEEP的核心算法通过逐步剔除最高排名tile(依据预测概率或注意力权重),直至WSI预测分数跌破分类阈值,从而确定必需区域。

结果部分显示:

  1. 区域选择动态分析:WEEP曲线直观展示不同模型的选择轨迹。例如,ResNet-18+75百分位策略平均选择32.34%的tile(95%CI:29.69-34.99%),而UNI+TransMIL组合需71.97%的tile(95%CI:68.66-75.29%),表明高级特征提取器倾向于更广泛的组织学特征整合。
  2. 空间分布可视化:在NHG 3级病例中,WEEP定位的区域多集中于肿瘤浸润前沿,与临床关注的异型性区域高度重合。热图对比显示,传统CAM方法仅标记局部高信号tile,而WEEP能识别对全局分类具有决定性影响的tile集群。
  3. 模型对比验证:注意力权重与预测概率的排序一致性分析揭示,UNI模型的特征表达更符合病理学家对高级别癌组织的形态学认知,其选择的区域包含更多核分裂象和结构紊乱模式。

讨论部分强调,WEEP的临床价值体现在三方面:

  • 决策透明化:为病理学家提供AI辅助诊断的可视化依据,例如在NHG判读中快速定位需复核的高风险区域。
  • 生物标志物发现:通过分析高频选择区域,可挖掘传统分级标准未涵盖的预后相关形态学特征。
  • 技术普适性:方法兼容回归任务(如生存预测)和多类分类,仅需调整终止条件(如预测值中位数)。

该研究的局限性在于tile级解释无法替代像素级分析,且结果依赖基础模型的质量。未来工作可结合光学密度特征或空间转录组数据,进一步解析区域选择的分子基础。作为首个系统性解决WSI弱监督模型空间可解释性的方法,WEEP为计算病理学从“黑箱预测”迈向“可验证决策”提供了关键工具。

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