琥珀酸代谢基因SLC25A4通过STAT3通路抑制肾透明细胞癌的机制研究及预后模型构建

【字体: 时间:2025年06月06日 来源:Scientific Reports 3.8

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  本研究针对肾透明细胞癌(ccRCC)中琥珀酸代谢异常与预后的关联,通过整合生物信息学分析和实验验证,首次构建了基于8个琥珀酸代谢相关基因(SMRGs)的预后模型,并揭示SLC25A4通过抑制STAT3信号通路和脂滴形成发挥抑癌作用。该研究为ccRCC的精准治疗提供了新靶点,发表于《Scientific Reports》。

  

肾透明细胞癌(ccRCC)作为泌尿系统高发恶性肿瘤,其独特的代谢重编程特征日益受到关注。琥珀酸代谢异常已被证实与多种肿瘤进展相关,但在ccRcc中其分子机制尚不明确。更棘手的是,ccRCC患者术后复发率高达40%,现有生物标志物难以精准预测预后。这些临床痛点促使研究者深入探索琥珀酸代谢相关基因(SMRGs)的调控网络及其临床应用价值。

济宁医学院附属医院的研究团队在《Scientific Reports》发表了一项突破性研究。他们通过TCGA和E-MTAB-1980数据库筛选出138个差异表达的SMRGs(DE-SMRGs),利用LASSO回归和Cox分析构建了包含ABCB1、BGLAP等8个基因的预后模型。机器学习显示SLC25A4(线粒体ADP/ATP转运蛋白)在模型中贡献度最高。实验验证证实SLC25A4通过抑制STAT3磷酸化(p-STAT3)和脂滴积累,显著抑制肿瘤增殖转移。该研究首次建立了SMRGs驱动的ccRcc预后分层系统,并揭示了SLC25A4-STAT3-脂代谢轴的新调控机制。

关键技术包括:1)基于TCGA-KIRC队列(526例)和E-MTAB-1980队列(101例)的转录组分析;2)LASSO回归结合多因素Cox构建风险评分模型;3)XGBoost机器学习评估基因重要性;4)免疫浸润分析(ESTIMATE/ssGSEA算法);5)体外实验(CCK-8、Transwell、油红O染色);6)裸鼠成瘤及肺转移模型。

研究结果

DE-SMRGs的筛选与功能富集
通过交叉分析获得138个DE-SMRGs,PCA显示其可有效区分癌与正常组织。GO分析揭示这些基因显著富集于视黄酸代谢(adjusted p<0.05),KEGG显示与碳代谢、丙酸代谢通路相关。

预后模型的构建与验证
8基因模型中,SLC25A4的SHAP值最高(0.72)。风险评分可独立预测预后(HR=2.34, 95%CI:1.67-3.28),3年AUC达0.79。高风险组免疫评分升高但CD8+
T细胞浸润减少,提示免疫逃逸特征。

SLC25A4的抑癌机制
临床样本验证SLC25A4在癌组织中低表达(免疫组化p<0.001)。过表达SLC25A4使786-O细胞增殖率下降63%(CCK-8),肺转移灶减少78%(小鼠模型)。机制上,SLC25A4通过降低p-STAT3(Tyr705)水平抑制脂滴积累(油红O染色减少41%),STAT3激动剂Colivelin可逆转此效应。

结论与意义
该研究创新性地将琥珀酸代谢异常与ccRCC预后相联系,构建的8基因模型较传统TNM分期具有更高预测精度(AUC提高12%)。发现SLC25A4-STAT3-脂代谢轴是调控ccRCC进展的关键通路,为开发靶向代谢-免疫联合治疗策略提供了理论依据。局限性在于尚未解析SLC25A4如何特异性调控STAT3磷酸化,未来可通过类器官模型和共免疫沉淀(Co-IP)进一步验证。

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