DNA折纸技术实现纳米尺度机械挫败结构:能量存储与纳米计算的革新路径

【字体: 时间:2025年06月06日 来源:Nature Communications 14.7

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  研究人员利用DNA折纸技术(DNA origami)首次在纳米尺度实现了机械挫败(mechanical frustration)结构,通过可重构支柱的定向调控,构建了具有独特自由能谱的挫败与非挫败态。该结构在弹性储能、纳米机械计算及DNA纳米机器变构机制中展现出潜力,突破了宏观尺度工程限制,为动态可变形纳米材料设计提供了新范式。

  

论文解读
在自然界和工程材料中,几何排列的巧妙设计往往能赋予材料超越其组分特性的功能。机械超材料(mechanical metamaterials)通过构建单元的特定排布,已实现负泊松比、形状变形等非凡性能。然而,受限于制造精度,机械挫败(mechanical frustration)——一种类似磁挫败的应变局域化现象——此前仅能在微米级以上尺度实现。如何将这一现象精准复现于纳米尺度,并实现动态调控,成为材料科学与纳米技术交叉领域的重大挑战。

为此,美国普渡大学的研究团队Anirudh S. Madhwacharyula等创新性地将DNA折纸技术与机械设计原理结合,构建了Kagome晶格启发的六边形纳米结构。该结构通过可编程DNA自组装实现了挫败与非挫败态的可逆切换,揭示了纳米尺度下应变分布与自由能景观的独特规律。相关成果发表于《Nature Communications》,为纳米级弹性储能器件和机械逻辑计算提供了全新设计思路。

关键技术方法
研究采用DNA折纸技术构建六边形纳米结构,通过化学加载(chemical loading)和紫外光(UV)触发实现结构重构;利用粗粒化分子动力学(MD)模拟平台oxDNA分析应变分布;结合伞采样(umbrella sampling)计算自由能谱;通过原子力显微镜(AFM)验证结构形貌与动态响应。

研究结果
1. 设计几何挫败
受Kagome晶格启发,团队设计了包含可调支柱(DNA jacks)的六边形DNA折纸结构。通过选择性激活支柱,结构可切换至挫败态(应变局域化)或非挫败态(均匀应变分布)。分子动力学模拟显示,挫败态自由能谱呈现双稳态(17-20 nm和28 nm两个最小值),而非挫败态为单一能量阱(图1h)。

2. 实验验证
通过两步DNA反应(链置换与重退火)和紫外光切割,团队实现了结构态的可逆转换。AFM图像清晰显示挫败态中边缘屈曲(buckling)现象(图2c,h),与非挫败态的均匀形变形成鲜明对比。化学加载施加的力约15 pN,与MD模拟结果一致。

3. 计算力学分析
应变映射揭示挫败态中特定边缘(如27号)持续承受高压缩力(图4f),而非挫败态应变均匀分布。屈曲边缘的弯曲挠度(bend deflection)随时间演化显著偏离基线(图4d),证实挫败态的能量局域化特性。

4. 拓展设计空间
通过调整支柱位置、减少输入数量或引入缺口缺陷(nick defects),团队实现了自由能谱的精准调控。例如,缺陷边缘的刚度降低使挫败态能量阱偏移至18 nm(图5h),而移除输入可恢复结构的适应性(图5c)。

结论与意义
该研究首次在纳米尺度实现了机械挫败的精准设计与动态调控,揭示了DNA折纸结构在能量存储与信息处理中的独特优势:

  1. 多稳态控制:挫败态的双稳态特性为纳米机械逻辑计算提供了物理载体;
  2. 能量路由:通过缺陷工程和输入调控,可定向分配应变能量,模拟生物分子(如肌动蛋白)的机械信号传递;
  3. 跨尺度设计:将宏观力学原理与纳米自组装结合,为下一代超材料开发开辟新路径。

这项工作不仅推动了DNA纳米技术向功能化、智能化发展,也为理解生物系统中的变构机制(allostery)和蛋白质折叠挫败(frustration)提供了人工模型。未来,通过整合更复杂的3D晶格和光/电响应元件,此类结构有望在纳米机器人、靶向药物递送等领域实现突破性应用。

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