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IvoryOS:面向Python驱动的自驱动实验室的互操作性网络界面设计与应用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月06日 来源:Nature Communications 14.7
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为解决自驱动实验室(SDLs)因缺乏标准化软件导致的开发门槛高、跨平台兼容性差等问题,研究人员开发了开源协调器IvoryOS。该系统通过动态生成网络界面实现Python脚本的即插即用控制,支持拖拽式工作流设计和无代码闭环实验配置。集成测试表明,IvoryOS可适配六种不同架构的SDL平台,显著提升自动化实验的灵活性和可及性。该成果发表于《Nature Communications》,为化学合成、材料开发等领域的智能实验系统提供了通用解决方案。
在化学合成和材料科学领域,自驱动实验室(Self-Driving Laboratories, SDLs)正通过机器人技术、自动化和人工智能的融合加速科学发现。然而,现有SDL系统面临一个关键瓶颈:缺乏通用软件框架导致不同实验室开发的平台互不兼容,研究人员不得不为每个硬件组合编写定制化脚本。这种碎片化开发现状不仅造成重复劳动,更将许多不具备专业编程能力的科学家拒之门外。
针对这一挑战,加拿大英属哥伦比亚大学和Telescope Innovations公司的联合团队开发了名为IvoryOS的开源协调系统。这项发表于《Nature Communications》的研究展示了一种创新方法——通过动态解析Python脚本自动生成交互式网络界面,使研究人员无需修改代码即可控制各类SDL硬件。该系统如同为实验室自动化设备装上了"智能操作系统",成功打通了从硬件控制到实验设计的全流程。
研究团队采用了几项核心技术:基于Python对象序列化的模块自动捕获技术,可将硬件API转化为可视化操作菜单;Flask框架构建的网络服务器架构,支持实时状态监控和远程访问;集成Ax平台的贝叶斯优化模块,实现实验参数的自主调优;以及结合大型语言模型(GPT-4)的自然语言编程接口,允许通过文字描述生成实验流程。这些技术共同构成了IvoryOS的四大核心功能模块。
Web服务器架构部分揭示了系统的设计哲学。通过动态加载SDL源代码,后端自动序列化所有自定义类实例,将其方法转化为可调用的网络表单。工作流脚本以字典结构存储,支持离线编辑和在线验证。执行引擎通过WebSocket实现实时状态反馈,形成完整的"设计-验证-执行"闭环。
直接控制界面展示了系统的适应性。系统能自动识别方法签名中的类型提示,生成包含整型、浮点、布尔等标准输入的交互表单。用户可自定义界面布局,这种灵活性使其既适用于成熟SDL平台的高阶控制,也能作为硬件原型开发的临时GUI。
工作流设计界面体现了创新的人机交互方式。通过拖拽式编程,用户可将"平衡称重"、"泵控制"等模块与逻辑判断(if/while)、延时等待等指令自由组合。特别值得注意的是文本转代码功能——输入"准备0.5M氢氧化钠溶液"等自然语言指令,系统能自动生成对应的操作序列,极大降低了工作流设计门槛。
工作流执行管理突显了系统的智能化特征。实验分为准备、主实验和清理三个阶段,其中主实验阶段支持三种运行模式:固定参数重复、手动参数迭代和基于贝叶斯优化的自适应实验。当检测到数值型输出时,系统自动激活优化算法界面,引导用户设置目标函数(如产率最大化或反应时间最小化)。
跨平台集成验证部分最具说服力。研究团队在六种架构迥异的SDL平台上测试了IvoryOS,包括:(1)专注于抗体-药物偶联物(ADC)合成的机械臂平台;(2)集成HPLC的PurPOSE纯化系统;(3)连续流动化学反应平台;(4)液-液萃取中试设备;(5)基于计算机视觉的溶解度筛选系统;(6)锂化合物在线衍生化分析装置。这些平台分别处于不同开发阶段,从成熟系统到原型设备均能无缝接入。
在闭环实验验证中,两个典型案例令人印象深刻。在溶解度平台,系统通过视觉反馈自动调节红蓝食用色素比例,直至达到目标颜色;在流动化学平台,原有优化算法被替换为更灵活的贝叶斯优化,实现了反应条件的自主探索。这些实验证实了IvoryOS在真实科研场景中的实用价值。
讨论部分指出,IvoryOS的创新性在于其"零配置"设计理念——不同于ChemIDE、AlabOS等需要深度适配的现有方案,该系统仅需10-30分钟即可完成部署。这种即插即用特性特别适合化学领域快速迭代的研究需求。但作者也坦承局限性:系统目前仅支持单线程工作流,缺乏并行任务调度能力;安全验证机制依赖于开发者的预先设置。
这项研究的深远意义在于打破了SDL开发的技术壁垒。通过将编程抽象转化为直观界面,IvoryOS使化学家能专注于科学问题而非代码调试。随着未来加入并行计算支持和模块化界面定制,该系统有望成为智能实验室的通用操作系统,推动自动化研究从专业团队向普通实验室的普及。源代码已开源在GitLab和Zenodo平台,为科学共同体提供了可扩展的技术基础。
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