环境抗生素耐药性监测：土壤与水源中七种细菌的全基因组测序分析

来自罗切斯特理工学院的研究人员通过全基因组测序技术，对校园环境中的土壤和水源样本进行耐药菌筛查，鉴定出7株具有多重耐药特征的细菌（如携带aac(6′)-li、blaCMY-101 等基因），揭示了环境AMR（抗菌素耐药性）的复杂传播机制，为全球公共卫生防控提供关键数据支撑。

　　

这项研究像一场微生物界的"基因侦探行动"——科研团队在罗切斯特理工学院的喷泉水和土壤中，捕获了7个狡猾的耐药细菌"逃犯"。通过精密部署培养策略（TSB培养基+25°C震荡培养）和药敏测试（CLSI M100标准），发现这些细菌对rifampicin（利福平）、vancomycin（万古霉素）等常用抗生素展现出令人警惕的抵抗力。

基因组测序仪化身"分子显微镜"，Illumina MiSeq平台以2×300循环的精度扫描细菌DNA。分析显示，Enterococcus faecium（屎肠球菌）RIT857携带三重耐药武器：aac(6′)-li（98.18%匹配）、msr(C)和erm(B)基因，而Serratia marcescens（粘质沙雷菌）RIT854则暗藏bla_SRT-2
（96.83%）这种β-内酰胺酶基因。有趣的是，Lactococcus lactis（乳酸乳球菌）虽然基因组干净得像"守法公民"，却对SXT（磺胺甲恶唑/甲氧苄啶）表现出令人意外的中间敏感性。

研究团队采用生物信息学"组合拳"：fastp进行数据质检，SPAdes完成基因组拼图，ResFinder则像耐药基因"雷达"（阈值设定90%相似度+60%覆盖度）。这些发现如同敲响生态警钟——环境中潜伏的耐药基因库（如tet(M)、tet(L)等四环素耐药基因）可能通过水平转移威胁人类健康。

特别值得一提的是，高中生团队通过RPHS-RIT合作项目参与研究，新一代科研力量正在耐药性防控战场崭露头角。这项研究不仅绘制了环境AMR的微观地图，更证明基因组学犹如"超级显微镜"，能提前预警看不见的公共卫生危机。