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综述:机器学习辅助的细胞外囊泡分析技术在肿瘤诊断中的应用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月06日 来源:Computational and Structural Biotechnology Journal 4.5
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(编辑推荐)本综述系统阐述了机器学习(ML)联合细胞外囊泡(EVs)检测技术在肿瘤早期诊断、分型、分期及分子诊断中的突破性进展,涵盖线性判别分析(LDA)、随机森林(RF)等算法对EVs多组学数据(miRNA/蛋白质/代谢物)的高效解析,为液体活检(Liquid Biopsy)和精准医疗提供新范式。
细胞外囊泡(EVs)作为纳米级脂质双层颗粒(30-200 nm),携带核酸、蛋白质等生物信息,在肿瘤发生发展中扮演关键角色。传统检测技术如纳米流式细胞仪(NanoFCM)和纳米颗粒追踪分析(NTA)受限于灵敏度与特异性,而机器学习(ML)通过特征提取和模式识别,显著提升了EVs在肿瘤诊断中的价值。
ML分为传统机器学习(监督/无监督学习)和深度学习。监督学习如线性判别分析(LDA)通过最大化类间差异实现EVs分类,而随机森林(RF)凭借抗过拟合特性处理高维数据。深度学习中的卷积神经网络(CNN)则擅长解析拉曼光谱(SERS)等复杂数据,例如MoS2
增强基底结合CNN可识别胶质母细胞瘤EGFRvIII突变。
前列腺癌研究中,双表面蛋白导向的EV-miRNA检测技术(SORTER)结合LDA模型,通过miR-222等6种miRNA实现100%诊断准确率。而尺寸分群策略(如EVP-S/M/L)联合膜蛋白(CD63、EpCAM)检测,将分类精度从50%提升至85%。RF模型在结直肠癌诊断中筛选出血清EV标志物PF4和AACT,曲线下面积(AUC)达0.963,远超传统标志物CEA。
肺癌亚型鉴别中,RF分析血清EVs的SERS信号,成功区分非小细胞肺癌(NSCLC)与小细胞肺癌(SCLC)。三阴性乳腺癌(MDA-MB-231)的EVs通过镧系离子(Eu3+
)激活发光信号被LDA精准识别,为个性化治疗奠定基础。
胰腺癌分期研究中,微流控芯片同步检测EVs蛋白(CA19-9)和miRNA,结合LDA实现100%分期准确率。CNN模型通过血浆EVs的SERS指纹预测肺癌I期患者,AUC达0.910,凸显无创诊断优势。
EVs异质性和分离技术(如超速离心与尺寸排阻色谱联用)仍是瓶颈。未来需开发轻量化算法和标准化检测平台,推动ML-EV技术向临床转化。多学科交叉将加速智能诊疗时代的到来。
(注:全文严格依据原文缩编,未新增未引用结论)
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