2023年欧洲肠道病毒D68持续流行及B3谱系VP1蛋白特异性氨基酸替换的进化研究

【字体: 时间:2025年06月06日 来源:Journal of Clinical Virology 4.0

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  本研究针对COVID-19大流行后肠道病毒D68(EV-D68)流行模式改变的问题,通过欧洲非脊髓灰质炎肠道病毒网络(ENPEN)多中心监测数据,揭示了2023年欧洲EV-D68持续传播及B3谱系病毒株VP1蛋白D554E等新型氨基酸替换的进化特征。研究证实EV-D68突破既往双年流行规律转为年度流行,并发现新发B3-3谱系与神经毒力相关位点的变异特征,为完善EV-D68监测体系和疫苗设计提供了重要依据。

  

近年来,一种名为肠道病毒D68(EV-D68)的病原体正在全球范围内引发公共卫生关注。这种病毒最初于1962年在加利福尼亚被发现,过去仅引起零星病例和小规模暴发。然而自2014年全球大流行以来,EV-D68不仅导致从普通感冒到重症肺炎的呼吸道疾病,更被发现与一种名为急性弛缓性脊髓炎(AFM)的罕见神经系统并发症相关,这种疾病会导致类似小儿麻痹症的瘫痪症状。令人担忧的是,COVID-19大流行似乎改变了EV-D68的传统流行模式,使其从双年周期转变为年度流行,这给疾病监测和防控带来了新的挑战。

为应对这一新形势,欧洲非脊髓灰质炎肠道病毒网络(ENPEN)的研究人员开展了一项大规模多中心研究。该研究收集了2023年来自19个欧洲国家41个机构的监测数据,共检测203,622份样本,通过分子流行病学分析和基因组测序技术,揭示了EV-D68在欧洲的最新流行特征和进化动态。相关成果发表在《Journal of Clinical Virology》上,为理解这一重要病原体的演变规律提供了关键证据。

研究采用了多学科交叉的研究方法:1)通过ENPEN网络收集19国41个机构2023年全年的流行病学监测数据;2)使用MEGA7软件构建VP1基因系统发育树分析病毒进化;3)采用氨基酸组成扫描技术(SSE)鉴定B3谱系特异性突变;4)对25株全基因组序列进行比对分析,重点关注VP1蛋白BC和DE免疫原性环的关键位点变异。

研究结果部分首先展示了流行病学特征:在2023年检测的203,622份样本中,共发现13,585例肠道病毒阳性(6.7%),其中402例(3.0%)为EV-D68,对应386个病例。流行呈现明显的季节性特征,10月达到高峰(136例,占35.2%)。值得注意的是,99%的阳性样本来自呼吸道标本,这与EV-D68主要通过呼吸道传播的特性相符。

在分子特征方面,系统发育分析显示2023年流行的EV-D68分为B3(69.7%)和A2/D2(30.3%)两个基因型。其中B3型病毒形成了全新的B3-3谱系,与2019-2022年流行的B3-1和B3-2谱系明显不同。这一新谱系与美国2022年流行的毒株高度相似,提示可能存在跨大西洋传播。

最引人注目的是氨基酸序列分析结果:在VP1蛋白中发现了7个B3-3谱系特异性突变,其中D554E替换是欧洲首次报道。该位点毗邻已知的神经毒力相关位点D554N,但发生了更为保守的谷氨酸(E)替换。研究还发现,虽然B3-3谱株携带了三个曾被报道与神经毒力相关的突变(I553L、A650T和K835E),但2023年欧洲并未报告AFM病例,这可能与D554E的保守性改变有关。

在讨论部分,研究者强调这项研究具有多重重要意义:首先,证实了EV-D68突破传统双年流行模式,转为持续年度流行,这可能是COVID-19防控措施解除后免疫债的表现。其次,发现B3-3这一全新谱系在欧洲的传播,其起源于美国2022年流行株,揭示了EV-D68的全球传播网络。最重要的是,鉴定出VP1蛋白D554E等关键氨基酸替换,为理解病毒进化与致病性的关系提供了新线索。

该研究也存在一定局限性,如临床数据收集不完整,未能全面评估病毒变异与疾病严重程度的关联。研究者建议未来应建立标准化的EV-D68监测系统,加强呼吸道样本的主动筛查,并开展更深入的分子机制研究,特别是要阐明D554E等突变对病毒抗原性和神经侵袭力的影响。这些工作将为EV-D68疫苗设计和疫情防控策略制定提供科学依据。

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