零售生鸡肉中弯曲菌的定量定性评估、基因组特征分析及其与人源感染菌株的比较研究

为解决生鸡肉中弯曲菌(Campylobacter)污染引发的公共卫生问题，瑞士研究人员开展了一项横断面研究，通过全基因组测序(WGS)技术对比分析零售鸡肉与临床感染菌株的基因组特征。研究发现62%冷藏鸡肉样本携带弯曲菌，其中29%菌株与人源感染株基因高度相似，并检出gyrA(T86I)突变、blaOXA 耐药基因及cstIII/neuABC等神经毒性毒力因子。该研究为食源性弯曲菌病的防控提供了重要数据支持，论文发表于《Journal of Food Protection》。

　　

弯曲菌是全球细菌性腹泻病的主要致病菌，其中禽肉制品的处理与消费是主要传播途径。尽管欧盟和瑞士已实施严格的卫生规范，但人类弯曲菌病病例数仍居高不下，且耐药菌株的出现使临床治疗面临挑战。更令人担忧的是，某些弯曲菌菌株携带的毒力因子可能引发吉兰-巴雷综合征(Guillain-Barré syndrome)甚至促进结直肠癌转移。这些现状凸显了厘清零售禽肉中弯曲菌污染特征及其与人类健康关联的紧迫性。

瑞士苏黎世大学的研究团队在《Journal of Food Protection》发表了一项突破性研究。他们采集了2024年5-8月瑞士零售渠道的350份鸡肉样本（含300份冷藏/冷冻肉和50份腌制品），采用ISO 10272标准方法进行定性/定量检测，并运用全基因组测序(WGS)技术对分离株进行基因组分析。研究同时纳入同期71例临床分离株，通过核心基因组多位点序列分型(cgMLST)构建系统发育树，解析耐药基因(AMR)和毒力因子(VF)的分布特征。

关键技术包括：1）ISO 10272-1/2标准方法检测样本中弯曲菌载量；2）基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)进行菌种鉴定；3）Illumina平台全基因组测序及FastQC质控；4）使用Resistance Gene Identifier(RGI)和AMRFinderPlus分析耐药基因；5）基于637个cgMLST靶基因构建最小生成树(MST)分析菌株亲缘性。

研究结果揭示：

1. 零售鸡肉中弯曲菌污染特征
   冷藏鸡肉污染率(62%)显著高于冷冻肉(11%)，有机/散养标签肉品污染率(72-77%)高于常规养殖产品(38%)。定量检测显示3.7%冷藏样本菌量＞100 CFU/g，最高达700 CFU/g。

2. 基因组流行病学关联
   29%的鸡肉源弯曲菌(C. jejuni)与40%人源菌株存在基因簇重叠，特别是ST21/ST45/ST475型菌株。来自瑞士本土的CT2633、CT2570等克隆复合体与多起人类感染事件相关，证实国产鸡肉是主要传染源。

3. 耐药与毒力特征
   52%菌株携带gyrA(T86I)突变导致氟喹诺酮耐药，26%检出tet(O)四环素耐药基因。3株菌携带增强型cmeABC外排泵(RE-cmeABC)，可介导高水平多药耐药。毒力分析发现18%菌株同时携带神经毒性因子cstIII+neuABC，88%携带促癌毒素基因cdtABC。

4. 风险干预措施评估
   冷冻处理使污染率降低5.6倍，腌制工艺使检出率下降35%。研究建议将零售鸡肉弯曲菌限量标准逐步收紧至100 CFU/g，最终达10 CFU/g。

这项研究首次系统揭示了瑞士零售鸡肉中弯曲菌的基因组多样性、耐药进化趋势及公共卫生风险。发现RE-cmeABC等新型耐药机制和神经毒性菌株的流行，为解释临床治疗失败和感染后并发症提供了分子依据。提出的冷冻/腌制干预策略具有实操性，为完善"从农场到餐桌"的食品安全管控体系提供了关键证据。该研究通过"One Health"视角，强调了食源性病原体在动物-人类-环境界面的传播风险，对全球弯曲菌防控政策的制定具有重要参考价值。