粪菌移植(FMT)消除抗生素耐药菌(ESBL-E/CRE)胃肠道定植的可行性随机对照试验：FERARO研究

为解决抗生素耐药菌(ESBL-E/CRE)胃肠道定植缺乏有效清除策略的问题，英国Guy’s and St Thomas’ NHS Foundation Trust团队开展了一项随机对照试验(FERARO)，评估冻干胶囊化粪菌移植(FMT)的安全性、可行性和初步疗效。结果显示FMT显著提高肠道菌群多样性，且基线菌群差异较大的患者更易实现耐药菌清除，为临床开发新型微生物干预策略提供了重要依据。

　　

抗生素耐药性(AMR)已成为全球公共卫生危机，其中产超广谱β-内酰胺酶肠杆菌(ESBL-E)和耐碳青霉烯类肠杆菌(CRE)尤为棘手。这些耐药菌常定植于胃肠道(GIT)，成为侵袭性感染的"蓄水池"。尽管部分患者可自发清除，但目前缺乏有效的主动清除手段。粪菌移植(FMT)在复发性艰难梭菌感染治疗中展现出调节菌群的潜力，但其对耐药菌定植的清除效果尚存争议。

英国伦敦Guy’s and St Thomas’ NHS Foundation Trust的Benjamin Mullish团队开展了FERARO试验，这是首个评估冻干胶囊化FMT清除ESBL-E/CRE定植的可行性随机对照研究。该研究采用双盲设计，将44例患者随机分配至FMT组(22例)或安慰剂组(22例)，通过培养法、多重PCR和宏基因组测序等多维度评估干预效果。论文发表在《Journal of Infection》，为微生物疗法在AMR领域的应用提供了关键证据。

研究采用三项核心技术：1) 符合GMP标准的冻干FMT胶囊制备技术；2) 表型(培养法)与基因型(多重PCR)结合的耐药菌检测体系；3) 基于全基因组测序的菌株水平分析(StrainPhlAn)技术。研究队列来自单一医疗中心的ESBL-E/CRE感染康复者。

【主要结果】

1. 可行性终点：27%的接触患者同意参与，83%符合条件者完成随机分组，证明后续大规模试验可行。
2. 安全性：FMT组腹胀(45% vs 10%)和皮肤不良反应发生率更高，但无严重相关不良事件。
3. 微生物组变化：FMT显著提升Shannon多样性指数(p<0.01)和肠道菌群健康指数(GMHI)(中位数-1.4→+0.1，p<0.001)，且菌株移植成功率与供受体基线差异正相关。
4. 耐药菌清除：虽然ESBL-E培养阳性率随时间降低(p<0.01)，但组间差异未达统计学意义。宏基因组显示头孢菌素耐药基因(ARG) reads减少(p<0.01)。

【结论与意义】
该研究首次系统评估了FMT用于ESBL-E/CRE清除的转化路径。尽管临床效果需更大样本验证，但发现两个关键生物学特征：1) 供受体菌群差异越大，清除效果越好(3/5 vs 0/12，p=0.01)；2) 菌株替代可能是作用机制——在成功清除者中观察到耐药菌优势菌株更替。这些发现为精准化微生物治疗提供了新思路。

研究创新性体现在三方面：采用胶囊化FMT提升依从性；建立菌株水平分析方法；首次将GMHI用于耐药菌研究。局限性包括单中心设计和CRE样本不足。作者建议未来研究应优化给药方案(如直肠给药)、探索供体筛选标准，并重点关注高危人群(如免疫抑制患者)。这项工作为抗击AMR提供了除新药开发外的替代策略，证实了微生物组干预在感染防控中的潜在价值。