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选择性同位素标记揭示异双金属Mn/Fe蛋白的化学能力与反应机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月06日 来源:Journal of Inorganic Biochemistry 3.8
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研究人员针对R2lox蛋白中酪氨酸-缬氨酸交联形成的争议性机制,通过选择性同位素标记结合多种光谱技术,证实该异双金属Mn/Fe辅因子可激活C?H键,并捕获到高价态MnIV /FeIV 中间体。该研究为理解Mn/Fe辅因子替代Fe/Fe辅因子的功能潜力提供了关键机制依据。
在生物化学领域,非血红素双铁羧酸盐蛋白家族以其多样的氧化反应能力著称,从氧运输到碳氢化合物氧化,这类蛋白几乎参与了所有挑战性生物转化过程。然而,近年来科学家们发现,某些家族成员竟能以锰/铁(Mn/Fe)异双金属辅因子形式发挥作用,这彻底颠覆了传统认知。其中,R2样配体结合氧化酶(R2lox)的表现尤为引人注目——它能在氧气激活时形成独特的酪氨酸-缬氨酸醚交联,但关于这个两电子氧化反应究竟始于酪氨酸O?H键还是缬氨酸C?H键的活化,学界一直争论不休。
俄亥俄州立大学Hannah S. Shafaat团队在《Journal of Inorganic Biochemistry》发表的研究,通过精妙的实验设计揭开了这一谜团。研究人员采用选择性同位素标记结合快速冷冻淬灭电子顺磁共振(EPR)等先进技术,首次捕捉到反应过程中的关键中间体,为理解Mn/Fe辅因子的独特化学能力提供了分子层面的证据。
关键技术方法包括:1)利用缬氨酸营养缺陷型大肠杆菌表达同位素标记蛋白(d8
V R2lox);2)通过紫外-可见光谱和低温EPR追踪反应动力学;3)采用快速冷冻淬灭技术捕获瞬态中间体;4)结合质谱分析验证同位素效应。所有实验均使用来自Geobacillus kaustophilus的R2lox蛋白。
【分离金属结合与氧活化步骤解析反应机制】
通过分步金属化和氧活化策略,研究人员成功解耦了传统实验中相互干扰的金属结合动力学与O2
活化过程。时间分辨光谱发现,反应先后经历620 nm特征吸收的瞬态中间体(I1
)和后续的EPR沉默物种(I2
),最终形成具有特征g=2信号的MnIV
/FeIV
中间体。这种分步策略首次清晰揭示了R2lox活化氧气的完整路径。
【同位素标记揭示C?H键活化的决定性作用】
通过比较普通溶剂与氘代缬氨酸(d8
V)标记蛋白的反应动力学,发现两者均呈现约2的同位素效应,证明C?H键活化是决速步骤。质谱分析进一步证实,反应涉及缬氨酸C?H键的直接断裂,而非先前假设的酪氨酸O?H优先活化机制。
【高自旋中间体的结构特征】
EPR检测到的MnIV
/FeIV
物种表现出与Ic类核糖核苷酸还原酶(RNR)相似的信号特征,但具有更显著的零场分裂参数。理论计算表明,这种差异源于R2lox活性位点独特的氢键网络,该网络通过质子耦合方式显著降低了C?H键活化能垒。
这项研究不仅阐明了R2lox催化缬氨酸C?H键活化的分子机制,更重要的是建立了Mn/Fe辅因子活化惰性C?H键的能量下限(BDFE)。发现的MnIV
/FeIV
中间体为理解异双金属辅因子的氧化能力提供了直接光谱证据,其与Ic类RNR的相似性暗示这类辅因子可能在进化中被广泛用于替代传统Fe/Fe中心。该成果为设计新型生物催化剂开辟了道路,特别是在需要选择性C?H官能团化的合成生物学应用中。论文最后指出,鉴于目前许多注释为Fe/Fe的蛋白可能实际采用Mn/Fe辅因子,未来需要重新评估这类蛋白的金属需求与催化机制。
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