宠物贸易中观赏小龙虾作为已知及新型病毒引入途径的病毒组学研究

为解决国际宠物贸易中观赏小龙虾可能携带病原体的问题，研究人员通过高通量测序技术分析了四种常见贸易小龙虾的病毒组，鉴定出7种已知病毒和8种新型RNA病毒，包括WSSV、Cherax quadricarinatus reovirus等。该研究揭示了宠物贸易作为病原体传播途径的潜在风险，为制定生物安全政策提供了重要依据。

　　

国际宠物贸易的繁荣为水生入侵物种的扩散提供了便利通道，其中观赏小龙虾因其鲜艳色彩备受追捧，却鲜少有人关注其可能携带的病原体风险。淡水小龙虾（Decapoda: Astacidea）作为生态系统工程师，其种群衰退已引发全球关注，而病原体入侵是导致这一现象的关键因素之一。尽管Aphanomyces astaci（引起小龙虾瘟疫的病原）和WSSV（白斑综合征病毒）等已知病原已被广泛研究，但宠物贸易小龙虾携带的病毒多样性仍是一片未知领域。更令人担忧的是，这些动物可能携带未知病毒，一旦被释放到自然环境中，可能引发新发疾病，威胁本土物种和生态系统健康。

针对这一科学问题，来自斯洛文尼亚的研究团队在《Journal of Invertebrate Pathology》发表了一项开创性研究。该团队采用宏基因组学方法，对四种欧洲宠物市场常见的观赏小龙虾（Procambarus clarkii、Procambarus alleni、Cherax holthuisi和Cherax quadricarinatus）的肝胰腺组织进行病毒组分析，揭示了这些贸易物种作为病毒传播载体的潜在风险。

研究采用的主要技术包括：从33只小龙虾肝胰腺组织中提取总RNA，通过核糖体RNA去除和Illumina NovaSeq6000平台进行双端测序；使用SPAdes软件进行从头组装，通过Diamond BLASTx比对NCBI数据库进行病毒序列鉴定；对重要病毒序列进行系统发育分析，并针对5种已知病毒设计特异性引物进行RT-PCR验证。

研究结果分为多个重要发现：

在病毒多样性方面，测序获得3.64-3.68×10⁸
条原始reads，组装出325条病毒样序列。其中18条序列与7种已知病毒高度相似，包括WSSV、Cherax quadricarinatus reovirus等；另有9条序列代表8种新型RNA病毒，与Picornavirales、Elliovirales等目病毒相关。

跨物种病毒分布显示，Shahe isopoda virus 5在P. alleni、P. clarkii和C. holthuisi中均有检出，而Dicistroviridae病毒在两种Procambarus物种间共享。值得注意的是，C. holthuisi（印尼新几内亚特有种）携带最多新型病毒，反映其隔离分布特征。

在P. clarkii中检出的WSSV尤其值得警惕，该病毒被世界动物卫生组织（WOAH）列为须申报疾病。RT-PCR证实2/7个体感染，其基因组片段与参考株有100%氨基酸同源性。此外还发现一株新型picorna样病毒（Virus-like contig 1），与Robinvale bee virus 6仅有26.6%氨基酸相似性。

C. quadricarinatus样本中，Cherax quadricarinatus reovirus、athtab bunya-like virus和chequa iflavirus的共感染现象与澳大利亚养殖场疫情报告一致。RT-PCR显示5/10个体同时携带这三种病毒，证实了垂直传播风险。系统发育分析还发现新型hepe样病毒和Ghabrivirales目病毒，后者与Beihai sea slater virus 3有31%相似性。

C. holthuisi携带的病毒最具独特性，包括一株与Permutotetraviridae科相关的新型病毒（Virus-like contig 258），与Astacus permutotetra-like virus 1仅有37.47%相似性；以及一株新型Polycipiviridae科病毒（Virus-like contig 255），其RdRp序列与已知病毒差异显著。

讨论部分强调，这项研究首次系统揭示了宠物贸易小龙虾携带的病毒多样性，包括高致病性的WSSV和多种新型RNA病毒。特别值得注意的是，P. clarkii作为欧盟禁止的入侵物种，仍通过错误标签进入贸易链并携带WSSV，突显监管漏洞。研究还发现，养殖来源的个体（如P. alleni）病毒多样性低于野生个体，可能与养殖过程中的瓶颈效应有关。

该研究的科学意义在于：为理解宠物贸易在病毒传播中的作用提供了实证数据；开发了检测多种小龙虾病毒的方法学框架；强调了加强边境检疫、完善物种鉴定和病毒监测的必要性。未来研究需要进一步评估这些病毒的宿主范围和致病性，特别是那些与已知病原体（如WSSV）共存的病毒可能产生的协同效应。这项成果为制定更严格的水生生物贸易监管政策提供了科学依据，对保护全球淡水生态系统健康具有重要意义。